More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0256 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  100 
 
 
329 aa  645    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  52.98 
 
 
323 aa  348  7e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  46.33 
 
 
322 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  46.33 
 
 
322 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.76 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  39.94 
 
 
337 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.42 
 
 
346 aa  219  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  39.22 
 
 
336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  38.36 
 
 
368 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  40.86 
 
 
359 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.8 
 
 
336 aa  205  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  36.28 
 
 
336 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  43.26 
 
 
346 aa  197  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  36.84 
 
 
355 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.24 
 
 
315 aa  194  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  37.04 
 
 
330 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  43.26 
 
 
346 aa  193  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  37.35 
 
 
330 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  35.87 
 
 
363 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  37.42 
 
 
351 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  35.56 
 
 
363 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.58 
 
 
351 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  36.67 
 
 
338 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  35.87 
 
 
334 aa  186  5e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  35.87 
 
 
334 aa  186  5e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  38.46 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  34.66 
 
 
354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  36.22 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.04 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  38.91 
 
 
369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  39.58 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  33.84 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  37.14 
 
 
336 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.36 
 
 
367 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  38.3 
 
 
339 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  36.36 
 
 
369 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  38.36 
 
 
353 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  31.08 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  33.56 
 
 
367 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  34.14 
 
 
372 aa  179  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  39.51 
 
 
344 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  33.97 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  37.58 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  38.36 
 
 
316 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.07 
 
 
340 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  34.28 
 
 
380 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  32.71 
 
 
350 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0754  FecCD transport family protein  38.03 
 
 
345 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.671626  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  35.4 
 
 
337 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  36.2 
 
 
349 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  33.43 
 
 
348 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  35.24 
 
 
332 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  36.2 
 
 
349 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  34.73 
 
 
340 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  31.79 
 
 
452 aa  176  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  34.28 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  33.44 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  35.03 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  34.89 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  34.29 
 
 
361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  34.63 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  36.97 
 
 
383 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  36.5 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  35.95 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  33.73 
 
 
376 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  34.9 
 
 
348 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  33.93 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.9 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  33.45 
 
 
343 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.8 
 
 
361 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1136  FecCD transport family protein  37.89 
 
 
322 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500551  normal  0.214464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  33.33 
 
 
321 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  34.24 
 
 
344 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  33.44 
 
 
347 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  33.85 
 
 
340 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  35.56 
 
 
360 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  35.07 
 
 
347 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.95 
 
 
367 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  33.74 
 
 
373 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 
359 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  34.31 
 
 
345 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  34.88 
 
 
312 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  33.86 
 
 
348 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  33.74 
 
 
355 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  35.46 
 
 
341 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  35 
 
 
341 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  35.71 
 
 
337 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  36.7 
 
 
357 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  35.33 
 
 
348 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
387 aa  169  7e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  34.28 
 
 
352 aa  169  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  34.41 
 
 
343 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  35.35 
 
 
350 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.56 
 
 
381 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  34.19 
 
 
359 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  34.68 
 
 
357 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  35.14 
 
 
364 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  34.62 
 
 
322 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>