More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1761 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  100 
 
 
326 aa  629  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  68.81 
 
 
327 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  60.69 
 
 
331 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1787  hemin ABC transporter, permease protein, putative  57.01 
 
 
328 aa  358  9e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  57.01 
 
 
328 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  56.7 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  37.73 
 
 
330 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.34 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.58 
 
 
315 aa  209  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40.28 
 
 
358 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.26 
 
 
367 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  35.99 
 
 
338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  37.24 
 
 
346 aa  199  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.6 
 
 
380 aa  199  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.58 
 
 
354 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  36.95 
 
 
338 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.98 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.67 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  39.37 
 
 
356 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01537  ABC-type hemin transport system, pemease component  38.94 
 
 
378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  36.62 
 
 
345 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  38.27 
 
 
338 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  36.72 
 
 
343 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  40 
 
 
367 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  35.54 
 
 
340 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  40.74 
 
 
345 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.43 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  35.12 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  37.28 
 
 
367 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  36.56 
 
 
368 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  39.09 
 
 
373 aa  189  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  38.16 
 
 
338 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 
366 aa  188  9e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  40.28 
 
 
362 aa  188  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.9 
 
 
348 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  34.56 
 
 
345 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  38.08 
 
 
330 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  38.51 
 
 
337 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.9 
 
 
348 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.82 
 
 
355 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  39.52 
 
 
372 aa  186  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
387 aa  185  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  42.55 
 
 
360 aa  185  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.31 
 
 
361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  37.81 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  38.31 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.33 
 
 
334 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  35.16 
 
 
334 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  35.16 
 
 
334 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  35.16 
 
 
334 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.33 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.15 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.99 
 
 
348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  41.61 
 
 
345 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
342 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  37.69 
 
 
338 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  37.69 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  37.69 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  37.69 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  36.59 
 
 
350 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
342 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.71 
 
 
351 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
342 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  33.68 
 
 
345 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  33.68 
 
 
345 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  34.85 
 
 
330 aa  178  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  35.69 
 
 
334 aa  178  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36 
 
 
371 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
342 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  33.68 
 
 
342 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
342 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.49 
 
 
334 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.49 
 
 
334 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  34.85 
 
 
318 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  35.03 
 
 
354 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  36.39 
 
 
361 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  33.33 
 
 
342 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  34.59 
 
 
344 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  35.79 
 
 
351 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.06 
 
 
363 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  37.8 
 
 
363 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  33.53 
 
 
373 aa  175  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.37 
 
 
370 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  37.2 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  35.93 
 
 
368 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  36.59 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  34.22 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  35.93 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  36.52 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  33.22 
 
 
347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  38.51 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  35.17 
 
 
336 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  35.12 
 
 
325 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  34.62 
 
 
344 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  34.78 
 
 
358 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.05 
 
 
367 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1755  heme transporter protein HuvC, transmembrane permease component  35.44 
 
 
345 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00487431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>