More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0447 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  100 
 
 		 340 aa  668    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  46.91 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  48.04 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.81 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  44.41 
 
 		 344 aa  275  8e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  46.38 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  41.62 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  42.2 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.52 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.77 
 
 		 354 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  41.19 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  44.06 
 
 		 359 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  42.94 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  41.29 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  43.81 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  41.35 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  39.44 
 
 		 354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  42.65 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  39.74 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  41.61 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  43.89 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  44.1 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  37.94 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  38.71 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  39.51 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  39.88 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.26 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  39.88 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.73 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  42.66 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  39.47 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  37.09 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  40 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  41.18 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  40.61 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.23 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  40.06 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  37.38 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  42.31 
 
 		 353 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.62 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  42.45 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  40.54 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  39.88 
 
 		 349 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  41.53 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  41.03 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.14 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  37.26 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.34 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.82 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  40.37 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.84 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.04 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  38.6 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  36.2 
 
 		 363 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  43.17 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  39.42 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  38.54 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.48 
 
 		 452 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  37.42 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 		 387 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  40.26 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  40.26 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.07 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.15 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.94 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.29 
 
 		 370 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  38.41 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  40.94 
 
 		 339 aa  195  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  37.23 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  40.19 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.71 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  40.75 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  38.01 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  41.4 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  41.55 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  36.86 
 
 		 354 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  37.94 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  37.1 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  37.39 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  35.34 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  37.18 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  35.21 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  38.73 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  38.93 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  40 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  40.18 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  37.58 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  43.27 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  44.2 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  35.43 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  38.57 
 
 		 353 aa  189  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  37.14 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  40.55 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  38.62 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  37.46 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.26 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  38.46 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>