More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1831 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  100 
 
 
376 aa  715    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  78.31 
 
 
367 aa  517  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  63.27 
 
 
373 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  65.75 
 
 
362 aa  378  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  58.88 
 
 
380 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  51.01 
 
 
315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  47.64 
 
 
337 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  45.16 
 
 
330 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  43.91 
 
 
330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  49.48 
 
 
315 aa  250  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  43.19 
 
 
387 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  43.94 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  49.67 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  49.83 
 
 
338 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  42.71 
 
 
350 aa  233  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  43.32 
 
 
363 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  39.94 
 
 
336 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  44.67 
 
 
346 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  48.99 
 
 
363 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  46.44 
 
 
321 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  47.35 
 
 
370 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  44.04 
 
 
367 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.92 
 
 
452 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  48.99 
 
 
334 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  48.99 
 
 
334 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  44.07 
 
 
361 aa  225  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  47.7 
 
 
345 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  43.59 
 
 
347 aa  223  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  45.97 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  46.49 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  43.77 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  42.3 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  46.9 
 
 
367 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  42.07 
 
 
359 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  47.02 
 
 
356 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  43.62 
 
 
355 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  43.75 
 
 
330 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  46.96 
 
 
358 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  45.4 
 
 
361 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  43.81 
 
 
334 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  43.81 
 
 
334 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  46.33 
 
 
371 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  45.97 
 
 
342 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  43.81 
 
 
334 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  42.18 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  44.3 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  43.66 
 
 
351 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  43.83 
 
 
334 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  46.18 
 
 
370 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  46.76 
 
 
429 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  43.42 
 
 
345 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  39.53 
 
 
331 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  41.16 
 
 
362 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  42.77 
 
 
350 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  42.31 
 
 
325 aa  205  9e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  43.58 
 
 
348 aa  205  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  43.38 
 
 
345 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  46.03 
 
 
365 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  43.89 
 
 
351 aa  203  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  43 
 
 
343 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  44.03 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  41.19 
 
 
338 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  41.69 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  41.69 
 
 
318 aa  200  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  45.98 
 
 
340 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  40.55 
 
 
368 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  41.72 
 
 
326 aa  199  9e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  41.11 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  44.19 
 
 
356 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  43.1 
 
 
325 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  45.36 
 
 
354 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  41.98 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  45.18 
 
 
365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  45.52 
 
 
341 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  44.63 
 
 
340 aa  196  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  47.33 
 
 
360 aa  196  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  38.06 
 
 
368 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
342 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  42.16 
 
 
344 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  41.72 
 
 
355 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.86 
 
 
336 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  38.08 
 
 
326 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.32 
 
 
351 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  42.03 
 
 
334 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  44.61 
 
 
349 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  41.64 
 
 
342 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  44.82 
 
 
343 aa  193  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.2 
 
 
390 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 
359 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  41.72 
 
 
342 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  37.88 
 
 
327 aa  192  6e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  36.44 
 
 
369 aa  192  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  39.34 
 
 
347 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
342 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  41.3 
 
 
345 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  40.61 
 
 
342 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  41.3 
 
 
342 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
342 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  44.7 
 
 
357 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  38.73 
 
 
368 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>