More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1565 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  100 
 
 		 355 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  46.18 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  45.42 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  41.62 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  45.92 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  43.77 
 
 		 370 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  47.18 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  45.59 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  43.69 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  46.1 
 
 		 343 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  41.89 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  43.62 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  44.01 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  41.12 
 
 		 345 aa  226  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  42.14 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  40.36 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  43.19 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.58 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4799  transport system permease protein  46.81 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000697014  hitchhiker  0.00165127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  44.44 
 
 		 361 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  46.6 
 
 		 360 aa  222  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0746  transport system permease protein  46.15 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  hitchhiker  0.0000000000140721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  47.77 
 
 		 342 aa  219  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  40.6 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  41.85 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  44.07 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40 
 
 		 452 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  48.04 
 
 		 365 aa  215  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2135  transport system permease protein  43.88 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370402  normal  0.644336 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.77 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  43.64 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.76 
 
 		 330 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  41.26 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  41.55 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  41.55 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  44.95 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  44.22 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  41.55 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.36 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  41.9 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1755  heme transporter protein HuvC, transmembrane permease component  39.76 
 
 		 345 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00487431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  45.89 
 
 		 341 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.92 
 
 		 363 aa  209  8e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.91 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  40.88 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  40.47 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.44 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  41.35 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  38.62 
 
 		 336 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  40.41 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.19 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.39 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  44.14 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  40.07 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0344  transport system permease protein  43.92 
 
 		 362 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  35.84 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  43.2 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1829  hemin ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  43.2 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5428  transport system permease protein  42.99 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5434  transport system permease protein  42.99 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.197656  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1119  hemin ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141906  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0828  hemin ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  42.21 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  42.21 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1777  hemin ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 		 409 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0343  hemin ABC transporter, permease protein  44.27 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0436  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.27 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  44.1 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  40.36 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4589  transport system permease protein  46.93 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0994  transport system permease protein  50.89 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00447104  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  42.01 
 
 		 343 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4686  transport system permease protein  49.11 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165164  hitchhiker  0.0000000000187173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  42.39 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.71 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  36.57 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4552  transport system permease protein  49.11 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00635879  hitchhiker  0.000000015041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  42.39 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  42.28 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  42.25 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  41.61 
 
 		 429 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  43.2 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  33.53 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  38.04 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.73 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  36.83 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.06 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4688  transport system permease protein  48.76 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  42.07 
 
 		 334 aa  193  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  36.7 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4193  transport system permease protein  42.31 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  37.85 
 
 		 362 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  40.69 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  36.34 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0213  putative ferrichrome ABC transporter permease  37.85 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  38.41 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  37.28 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.56 
 
 		 390 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>