More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0372 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  100 
 
 		 429 aa  821    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  64.01 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  56.99 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  55.85 
 
 		 390 aa  325  8.000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  54.71 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  51.1 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  51.28 
 
 		 354 aa  298  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  46.36 
 
 		 366 aa  282  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2760  transport system permease protein  58.55 
 
 		 361 aa  276  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.325591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  46.31 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  46.27 
 
 		 370 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  48.05 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  47.71 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  46.84 
 
 		 371 aa  253  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  44.66 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  50.17 
 
 		 365 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  42.64 
 
 		 368 aa  246  8e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  41.5 
 
 		 366 aa  245  9e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  44.68 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  51.89 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.85 
 
 		 362 aa  236  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  36.72 
 
 		 359 aa  235  9e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  43.3 
 
 		 326 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  48.46 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  44.82 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  44.82 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  44.82 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  44.38 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3878  transport system permease protein  58.92 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  42.73 
 
 		 368 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  46.39 
 
 		 361 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.26 
 
 		 330 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  39.81 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.26 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5428  transport system permease protein  46.07 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5434  transport system permease protein  46.07 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.197656  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  45.37 
 
 		 338 aa  227  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  47.5 
 
 		 341 aa  226  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  40 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  40.25 
 
 		 345 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  47.77 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 		 343 aa  223  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  44.76 
 
 		 334 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  44.41 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  44.44 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  43.4 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  47.63 
 
 		 342 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.01 
 
 		 350 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4835  transport system permease protein  46.8 
 
 		 361 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  43.64 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  41.61 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  48.56 
 
 		 367 aa  217  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.95 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.38 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  44.59 
 
 		 380 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4193  transport system permease protein  46.07 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  39.37 
 
 		 345 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  40.23 
 
 		 345 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3335  transport system permease protein  49.26 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984854  hitchhiker  0.00152467 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  42.22 
 
 		 363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  45.66 
 
 		 338 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  42.27 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  43.43 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  41.58 
 
 		 318 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  40.14 
 
 		 346 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0344  transport system permease protein  45.34 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0343  hemin ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  36.06 
 
 		 375 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2135  transport system permease protein  44.59 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370402  normal  0.644336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  43.77 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0436  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.85 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1829  hemin ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 		 373 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  45.26 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1777  hemin ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 		 409 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0828  hemin ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 		 373 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295306  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1119  hemin ABC transporter, permease protein  45.85 
 
 		 373 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141906  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.41 
 
 		 315 aa  210  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  43.54 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4775  transport system permease protein  48.32 
 
 		 365 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  43.88 
 
 		 350 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 		 343 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  40.07 
 
 		 367 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  45.61 
 
 		 334 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  45.61 
 
 		 334 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0746  transport system permease protein  47.24 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  hitchhiker  0.0000000000140721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.26 
 
 		 361 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4799  transport system permease protein  48.97 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000697014  hitchhiker  0.00165127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.54 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  35.31 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  41.27 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  39.23 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0218  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  49.83 
 
 		 362 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  45.99 
 
 		 360 aa  206  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  49.65 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  40.48 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5318  transport system permease protein  47.77 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4589  transport system permease protein  47.32 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0426385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  43.49 
 
 		 373 aa  204  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  41.98 
 
 		 334 aa  203  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>