More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1943 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  100 
 
 
338 aa  656    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  46.55 
 
 
354 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  40.57 
 
 
350 aa  226  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  37.23 
 
 
336 aa  225  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  43.4 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  41.18 
 
 
367 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  44.28 
 
 
340 aa  217  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  44.36 
 
 
358 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  41.11 
 
 
354 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.61 
 
 
330 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40.21 
 
 
356 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.61 
 
 
330 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.75 
 
 
347 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.12 
 
 
337 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  37.18 
 
 
368 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.93 
 
 
370 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  41.01 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  42.86 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  40.88 
 
 
367 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  39.63 
 
 
368 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  40.28 
 
 
371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.58 
 
 
452 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  43.11 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.11 
 
 
338 aa  196  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  39.18 
 
 
366 aa  195  7e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  41.32 
 
 
370 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  36.53 
 
 
330 aa  195  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  37.28 
 
 
363 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 
343 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.58 
 
 
315 aa  192  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  38.75 
 
 
345 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.64 
 
 
318 aa  192  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  39.29 
 
 
330 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.09 
 
 
315 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  39.94 
 
 
380 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  42.01 
 
 
358 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40.28 
 
 
334 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40.28 
 
 
334 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40.28 
 
 
334 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  41.1 
 
 
356 aa  189  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.59 
 
 
346 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  40.07 
 
 
361 aa  188  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  40.5 
 
 
341 aa  188  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  41.28 
 
 
345 aa  189  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  36.56 
 
 
363 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.84 
 
 
345 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  37.13 
 
 
338 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.75 
 
 
390 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  42.18 
 
 
360 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  40.06 
 
 
322 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  37.02 
 
 
354 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  40.68 
 
 
429 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.33 
 
 
361 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  39.81 
 
 
334 aa  185  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  34.34 
 
 
333 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  36.87 
 
 
338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  38.44 
 
 
326 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  35.5 
 
 
331 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  31.98 
 
 
355 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  37.24 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  41.08 
 
 
342 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  40.07 
 
 
334 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1755  heme transporter protein HuvC, transmembrane permease component  38.44 
 
 
345 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00487431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  39.09 
 
 
334 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  37.94 
 
 
345 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  37.43 
 
 
365 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  35.78 
 
 
387 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.55 
 
 
348 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.86 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.86 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  40.64 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  35.42 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  41.99 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.55 
 
 
348 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  38.7 
 
 
360 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  37.25 
 
 
357 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  38.11 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  38.54 
 
 
342 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  38.13 
 
 
357 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  34.59 
 
 
343 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  37.62 
 
 
353 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  39.65 
 
 
350 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  39.3 
 
 
369 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  37.59 
 
 
342 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  37.2 
 
 
347 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  38.32 
 
 
343 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  37.59 
 
 
345 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  37.59 
 
 
345 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  37.59 
 
 
342 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
342 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  32.59 
 
 
323 aa  176  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
342 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  34.28 
 
 
347 aa  175  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  33.66 
 
 
343 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  37.09 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  40.45 
 
 
367 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  36.51 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  37.59 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  38.38 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>