More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0250 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  100 
 
 		 340 aa  661    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  56.98 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  54.34 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  52.31 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  48.99 
 
 		 348 aa  348  6e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  48.41 
 
 		 348 aa  347  1e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  48.99 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  48.3 
 
 		 358 aa  338  9e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  48.84 
 
 		 349 aa  332  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  47.26 
 
 		 356 aa  322  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  48.55 
 
 		 357 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  47.69 
 
 		 355 aa  318  6e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  47.76 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  47.46 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  43.49 
 
 		 370 aa  309  4e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  45.11 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  47.1 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  45.66 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  45.56 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  44.09 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  46.81 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.09 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  41.4 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  42.9 
 
 		 356 aa  259  3e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  43.14 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  40.99 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  41.67 
 
 		 350 aa  245  9e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  42.54 
 
 		 367 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  40.13 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  42.94 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.94 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  41.49 
 
 		 374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  38.82 
 
 		 369 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  42.36 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  39.44 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  43.73 
 
 		 301 aa  219  7e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.75 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  39.02 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.82 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  36.7 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 		 356 aa  205  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  37.46 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 		 342 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  40.13 
 
 		 345 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  38 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  42.31 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  39.08 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  34.92 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  37.65 
 
 		 355 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  38.89 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 		 342 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  35.82 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  39.42 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.6 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  40.28 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  37.69 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  36.47 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 		 342 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 		 342 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  35.88 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  39.48 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  39.48 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  39.48 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  39.48 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  40.72 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  36.22 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  36.72 
 
 		 357 aa  195  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  39.71 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  35.59 
 
 		 356 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.97 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  35.8 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  38.26 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  35.63 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  40 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  36.5 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  40.99 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  38.49 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.99 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.26 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.96 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  37.94 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  38.6 
 
 		 336 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  36.75 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  39.43 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  41.88 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  35.45 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  37.45 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  35.61 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  37.28 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  42.35 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.36 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.28 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.28 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  33.71 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  33.71 
 
 		 364 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  36.33 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>