More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0657 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  100 
 
 		 346 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0219  transport system permease protein  69.37 
 
 		 344 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  54.71 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1450  transport system permease protein  58.58 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2523  ferric ion ABC transpoter (permease)  60.83 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8854  transport system permease protein  54.73 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1232  transport system permease protein  58.84 
 
 		 339 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  53.94 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  53.14 
 
 		 363 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28060  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  58.84 
 
 		 355 aa  245  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  45.2 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  40.83 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  38.87 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  42.77 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  43.06 
 
 		 315 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  42.5 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  38.82 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.25 
 
 		 356 aa  209  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  43.18 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.54 
 
 		 347 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  39.94 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  39.16 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.72 
 
 		 350 aa  205  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.52 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.93 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  48.24 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  42.53 
 
 		 354 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.62 
 
 		 354 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  42.15 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  39.32 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  40.74 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  42.12 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  36.78 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.58 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.33 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.33 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.82 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  40.06 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  41.1 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  34.71 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  36.25 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.41 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  44.4 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  38.04 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.87 
 
 		 367 aa  192  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  42.07 
 
 		 344 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  40 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  37.3 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1121  transport system permease protein  43.16 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  39.94 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  37.5 
 
 		 350 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  46.5 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.35 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.67 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  38.92 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  36.97 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  41.9 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  34.93 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  39.31 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  38.06 
 
 		 344 aa  186  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  45.94 
 
 		 336 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  34.24 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  37.74 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  37.85 
 
 		 327 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  42.7 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  39.37 
 
 		 381 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  31.29 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  39.53 
 
 		 380 aa  182  7e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  39.37 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  37.17 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.87 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  39.66 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  34.22 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  30.99 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  37.27 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  37.66 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  38.18 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  42.28 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  35.26 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  38.68 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  41.55 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  32.93 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  37.5 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  38.39 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.46 
 
 		 362 aa  179  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  42.9 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  40.21 
 
 		 350 aa  179  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.87 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0230  transport system permease protein  41.03 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  41.16 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  40.96 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  34.89 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  39.31 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  35.86 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  42.24 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>