More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_28060  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 		 355 aa  667    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  58.61 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  54.92 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1450  transport system permease protein  55.65 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  58.88 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  58.56 
 
 		 362 aa  265  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0219  transport system permease protein  60.75 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2523  ferric ion ABC transpoter (permease)  57.78 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8854  transport system permease protein  50.42 
 
 		 453 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1232  transport system permease protein  57.79 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  44.76 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  43.49 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.5 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  43.31 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.7 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.99 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  39.38 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.61 
 
 		 330 aa  209  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  47.14 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  47.14 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  41.78 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.45 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  36 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.53 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.56 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  47.42 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  38.31 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  39.02 
 
 		 345 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  36.31 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  40.62 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  45.26 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  45.02 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.66 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  33.71 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  42.01 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  43.15 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  41.5 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.3 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.68 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.09 
 
 		 354 aa  185  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  40.41 
 
 		 369 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  36.23 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  40.43 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  35.11 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.67 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  39.56 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  39.72 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.15 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.12 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  44.01 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  40.19 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  41.21 
 
 		 340 aa  179  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  32.92 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35.57 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2311  transport system permease protein  42.56 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  38.89 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  36.76 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  37.69 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.46 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  39.72 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0024  transport system permease protein  47.99 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  35.87 
 
 		 344 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.01 
 
 		 370 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  40.07 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  40.07 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  37.69 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  40.77 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  37.54 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  39.93 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.64 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  40.07 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  40.59 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  36.93 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  40.14 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  36.6 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  30.23 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3078  transport system permease protein  45.72 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0306769  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  39.86 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  40.81 
 
 		 340 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  35.23 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.61 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  37.76 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  39.42 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  39.86 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  37.95 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  43.59 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  31.49 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  41.55 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  45.04 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  38.84 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  39.88 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0796  transport system permease protein  41.24 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>