More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2523 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2523  ferric ion ABC transpoter (permease)  100 
 
 
378 aa  700    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.507861  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1232  transport system permease protein  75.75 
 
 
339 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1450  transport system permease protein  66.08 
 
 
347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  60.31 
 
 
346 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8854  transport system permease protein  57.46 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319989  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  58.09 
 
 
362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  56.59 
 
 
334 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  57.37 
 
 
363 aa  292  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0219  transport system permease protein  65.69 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336613  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28060  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  57.73 
 
 
355 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.48 
 
 
337 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  42.38 
 
 
363 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  42.32 
 
 
363 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  41.74 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  42.16 
 
 
315 aa  209  6e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.36 
 
 
358 aa  209  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  39.32 
 
 
353 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  41.34 
 
 
361 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.35 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.86 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.01 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.01 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  37.34 
 
 
345 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.72 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  37.8 
 
 
368 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.45 
 
 
354 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.76 
 
 
330 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.06 
 
 
330 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.54 
 
 
367 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  38.01 
 
 
368 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  40.07 
 
 
345 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
342 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  44.55 
 
 
338 aa  193  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  39.88 
 
 
337 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  43.08 
 
 
356 aa  192  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  36.59 
 
 
359 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  41.53 
 
 
380 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  41.28 
 
 
350 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.84 
 
 
334 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  38.53 
 
 
355 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  43.06 
 
 
367 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  37.58 
 
 
355 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.45 
 
 
315 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  39.08 
 
 
327 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  39.59 
 
 
347 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  39.37 
 
 
338 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  36.24 
 
 
343 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  40.94 
 
 
347 aa  186  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.49 
 
 
452 aa  186  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  37.98 
 
 
331 aa  186  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  38.89 
 
 
361 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  35.54 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  38.2 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  41.18 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  34.81 
 
 
369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  40.64 
 
 
352 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 
342 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.51 
 
 
371 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  39.71 
 
 
345 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  39.71 
 
 
345 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  39.71 
 
 
342 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  39.71 
 
 
342 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  40.37 
 
 
348 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  39.34 
 
 
342 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  39.34 
 
 
342 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2311  transport system permease protein  41.19 
 
 
351 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0230  transport system permease protein  40.81 
 
 
352 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  39.34 
 
 
342 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
339 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.57 
 
 
367 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  38.44 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  38.57 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  40.12 
 
 
354 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  38.98 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  39.04 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  37.58 
 
 
365 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  40.97 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  37.88 
 
 
340 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  37.65 
 
 
370 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  40.54 
 
 
332 aa  179  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 
356 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  45.16 
 
 
359 aa  179  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  37.07 
 
 
340 aa  179  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  41.78 
 
 
356 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  44 
 
 
340 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  38.8 
 
 
330 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  38.42 
 
 
365 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  38.71 
 
 
326 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  38.89 
 
 
351 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3078  transport system permease protein  43 
 
 
347 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0306769  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  32.72 
 
 
336 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  42.49 
 
 
357 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  36.31 
 
 
369 aa  176  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  35.91 
 
 
344 aa  176  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  34.83 
 
 
328 aa  176  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
328 aa  176  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.19 
 
 
336 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>