More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3078 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3078  transport system permease protein  100 
 
 		 347 aa  654    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0306769  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0230  transport system permease protein  76.05 
 
 		 352 aa  381  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.81 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.09 
 
 		 330 aa  212  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.5 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.67 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  44.03 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  47.93 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.05 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  42.35 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  42.35 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  39.51 
 
 		 344 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  46.9 
 
 		 362 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  39.05 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.99 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  38.58 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.69 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  39.3 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  38.37 
 
 		 348 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  38.46 
 
 		 368 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  38.96 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.96 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  38.37 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  44.02 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  36.12 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0024  transport system permease protein  48.09 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  37.64 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  41.46 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  37.62 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  35.84 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  39.3 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  43.47 
 
 		 358 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  37.67 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.63 
 
 		 371 aa  189  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  36.68 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  41.59 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.53 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  36.27 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  42.24 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1541  transport system permease protein  47.81 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0230541  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  41.95 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  41.28 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  40.07 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  38.62 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  41.45 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  38.87 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4279  iron compound ABC transporter, permease  33.13 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.551381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  41.86 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  41.28 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  34.49 
 
 		 340 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2551  transport system permease protein  46.13 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  41.87 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  37.61 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  36.44 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4654  iron compound ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  37.42 
 
 		 322 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0583  iron compound ABC transporter, permease protein  33.43 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4659  iron compound ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4440  iron compound ABC transporter permease  33.13 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4785  iron compound ABC transporter permease protein  33.13 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.66 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0513  iron ABC transporter, permease protein  43.55 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132048  normal  0.109169 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.52 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1055  transport system permease protein  45.6 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  37.27 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  39.06 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4672  iron compound ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  37.67 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  35.35 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  43.2 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  42.15 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4290  iron compound ABC transporter, permease  32.24 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  38.89 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  38.44 
 
 		 356 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.98 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  37.61 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  36.07 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  36.15 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  40.07 
 
 		 367 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  33.93 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  40.13 
 
 		 326 aa  176  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  35.61 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 		 366 aa  175  8e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  39.16 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  34.81 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  39.88 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  33.24 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  35.21 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4669  iron compound ABC transporter, permease protein  31.94 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  41.3 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  41.3 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  42.12 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  42.57 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  41.3 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  42.2 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  34.51 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  37.34 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>