More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0513 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0513  iron ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 353 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132048  normal  0.109169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2306  Iron(III) dicitrate-binding protein  63.81 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409919  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2663  transport system permease protein  63.95 
 
 		 335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2551  transport system permease protein  55.16 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1541  transport system permease protein  54.84 
 
 		 344 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0230541  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2363  transport system permease protein  52.84 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1016  transport system permease protein  53.4 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1100  transport system permease protein  53.4 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2781  transport system permease protein  54.61 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4775  transport system permease protein  53.23 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2793  transport system permease protein  56.09 
 
 		 327 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2620  transport system permease protein  54.42 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.82 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3078  transport system permease protein  43.89 
 
 		 347 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0306769  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0230  transport system permease protein  46.71 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  39.23 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  39.23 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  42.03 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  39.23 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.56 
 
 		 337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  32.7 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  42.51 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  38.82 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  41.55 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  39.88 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.33 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  39.51 
 
 		 346 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  39.25 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  34.71 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  36.54 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  42.61 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  37.1 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  37.95 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  42.62 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  35.22 
 
 		 353 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  38.46 
 
 		 348 aa  153  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  37.09 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  36.88 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1625  vtamin B12-transporter permease  38.91 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  34.67 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  34.57 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  34.57 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  34.57 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  37.78 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  36.65 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  39.51 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  34.38 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  33.23 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  35.64 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  34.1 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40.64 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1450  transport system permease protein  44.64 
 
 		 347 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  34.74 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.03 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  36.59 
 
 		 352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  36.92 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  35.91 
 
 		 363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  35.57 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  34.84 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  32.15 
 
 		 345 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.82 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  37.3 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  37.02 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  35.97 
 
 		 363 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  39.51 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  36.59 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  35.33 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  36.72 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  36.61 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  38.31 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  38.06 
 
 		 361 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  35.4 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  35.4 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  33.72 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  38.16 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  34.55 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  36.14 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  35.81 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  33.65 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  34.25 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  33.64 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  37.28 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  38.81 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.13 
 
 		 678 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  29.83 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.13 
 
 		 678 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  35.64 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  35.31 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  36.45 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.3 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  39.73 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>