More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2781 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2781  transport system permease protein  100 
 
 		 344 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2363  transport system permease protein  82.84 
 
 		 339 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2551  transport system permease protein  71.17 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1541  transport system permease protein  71.15 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0230541  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1016  transport system permease protein  70.59 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1100  transport system permease protein  70.59 
 
 		 360 aa  342  4e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4775  transport system permease protein  72.55 
 
 		 307 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2620  transport system permease protein  70.69 
 
 		 358 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2793  transport system permease protein  70.78 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0513  iron ABC transporter, permease protein  52.23 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132048  normal  0.109169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2663  transport system permease protein  60.96 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2306  Iron(III) dicitrate-binding protein  59.38 
 
 		 336 aa  225  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409919  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3078  transport system permease protein  46.37 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0306769  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.26 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0230  transport system permease protein  43.67 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  37.63 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  35.42 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.25 
 
 		 452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  35.83 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.91 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  38.62 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  35.9 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.8 
 
 		 347 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  37.84 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.45 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  38.82 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  30.54 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  30.22 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.86 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  41.02 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  41.18 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  35.69 
 
 		 369 aa  155  8e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  35.92 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  35.92 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  35.92 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  35.87 
 
 		 375 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  40.14 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  39.38 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  30.18 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  40.61 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  36.71 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  35.94 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.81 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.76 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.68 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  39.16 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  36.27 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  38.01 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  30.24 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1431  transport system permease protein  35.76 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.3 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  36.36 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  35.31 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  37.98 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  38.73 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  36.36 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  37.76 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  35.67 
 
 		 357 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  37.74 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  37.24 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  29.21 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1450  transport system permease protein  39.58 
 
 		 347 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  36.33 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  32.53 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  38.36 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.36 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  36.88 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  34.36 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  35.19 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  31.79 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  35.62 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  38.1 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  37.04 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  37.04 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  37.76 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  35.64 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.11 
 
 		 678 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  35.9 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  38.6 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  35.54 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.41 
 
 		 678 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  39.18 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.41 
 
 		 678 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  38.65 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  38.38 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.41 
 
 		 678 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  33.13 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.84 
 
 		 367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.65 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  36.68 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  38.65 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  38.65 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.26 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  38.65 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  38.65 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  38.65 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  38.65 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  36.77 
 
 		 368 aa  146  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>