More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1731 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  100 
 
 
351 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  76.69 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  76.38 
 
 
326 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  76.69 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  76.69 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  76.69 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0354813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01680  vtamin B12-transporter permease  76.69 
 
 
326 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1931  transport system permease protein  76.69 
 
 
326 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00205827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2429  vtamin B12-transporter permease  76.99 
 
 
326 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01669  hypothetical protein  76.69 
 
 
326 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.028051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1930  vtamin B12-transporter permease  76.69 
 
 
326 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1479  vtamin B12-transporter permease  76.69 
 
 
326 aa  441  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.950653 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1920  vtamin B12-transporter permease  76.38 
 
 
326 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1791  vtamin B12-transporter permease  76.38 
 
 
326 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.979653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1915  vtamin B12-transporter permease  76.07 
 
 
326 aa  434  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  67.97 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  67.97 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  67.97 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  65.52 
 
 
335 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2469  vtamin B12-transporter permease  64.46 
 
 
345 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2775  vtamin B12-transporter permease  64.48 
 
 
345 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.574344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1625  vtamin B12-transporter permease  66.44 
 
 
333 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1654  vtamin B12-transporter permease  68.01 
 
 
333 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81431  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  45.14 
 
 
337 aa  258  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02132  vtamin B12-transporter permease  47.34 
 
 
331 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0864  vtamin B12-transporter permease  46.71 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.14 
 
 
370 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  40.13 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  41.73 
 
 
347 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.71 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40.34 
 
 
358 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.34 
 
 
354 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  40.56 
 
 
338 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  40.34 
 
 
345 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  41.67 
 
 
338 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  41.55 
 
 
330 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 
366 aa  191  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  36.96 
 
 
315 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  41.55 
 
 
318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  37.62 
 
 
356 aa  189  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  39.79 
 
 
334 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 
343 aa  188  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.39 
 
 
371 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.34 
 
 
351 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  39.66 
 
 
356 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  42.66 
 
 
340 aa  186  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0746  transport system permease protein  43.55 
 
 
345 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  hitchhiker  0.0000000000140721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  38.9 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  44.56 
 
 
338 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40.34 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40.34 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40.34 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  37.68 
 
 
337 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  39.13 
 
 
361 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  35.07 
 
 
350 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  39.66 
 
 
345 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  37.46 
 
 
368 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  40 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.56 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.93 
 
 
452 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  35.96 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4799  transport system permease protein  45.64 
 
 
345 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000697014  hitchhiker  0.00165127 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  36.43 
 
 
344 aa  179  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  42.32 
 
 
358 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  40.91 
 
 
341 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  41.28 
 
 
365 aa  175  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  37.46 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  42.7 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  35.4 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  37.1 
 
 
355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  38.83 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  42.5 
 
 
338 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  38.52 
 
 
325 aa  173  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  40.36 
 
 
345 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  42.66 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  36.95 
 
 
365 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  36.33 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  35.79 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  38.6 
 
 
340 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  42.32 
 
 
338 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  41.98 
 
 
338 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  42.32 
 
 
338 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  41.98 
 
 
338 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  40.14 
 
 
361 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.67 
 
 
368 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  40.14 
 
 
338 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  38.11 
 
 
351 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  37.05 
 
 
338 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  38.51 
 
 
326 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  32.46 
 
 
348 aa  170  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  36.86 
 
 
373 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  32.2 
 
 
327 aa  170  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  30.21 
 
 
336 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  32.75 
 
 
348 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  32.18 
 
 
330 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  41.13 
 
 
334 aa  169  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  35.59 
 
 
348 aa  169  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  41.22 
 
 
334 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>