More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 
354 aa  653    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  48.71 
 
 
369 aa  261  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  45.73 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  45.12 
 
 
346 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  48.11 
 
 
340 aa  238  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  46.71 
 
 
346 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  46.46 
 
 
346 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  45.82 
 
 
340 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  46.79 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  44.71 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  49.06 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  46.56 
 
 
347 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  51.37 
 
 
340 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  48.62 
 
 
338 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  45 
 
 
353 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  43.48 
 
 
332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  48.46 
 
 
346 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2417  transport system permease protein  48.26 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3278  transport system permease protein  47.63 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.41 
 
 
367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2654  transport system permease protein  47.85 
 
 
382 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00408489  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  45.79 
 
 
328 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  45.99 
 
 
381 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  45.48 
 
 
347 aa  216  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1427  transport system permease protein  51.1 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.735096  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2057  transport system permease protein  46.37 
 
 
338 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.441726  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  43.53 
 
 
351 aa  209  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1361  transport system permease protein  47.01 
 
 
357 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.81 
 
 
361 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23970  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.34 
 
 
369 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.597722  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1137  transport system permease protein  43.91 
 
 
342 aa  205  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  44.18 
 
 
452 aa  205  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  47.48 
 
 
350 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  38.26 
 
 
346 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  46.06 
 
 
373 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  46.37 
 
 
356 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  41.96 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  40.87 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40.95 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3391  ABC Fe3+-siderophores transporter, inner membrane subunit  48.42 
 
 
344 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.581639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3037  transport system permease protein  48.42 
 
 
344 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  43.17 
 
 
340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  42.86 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  47.7 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  42.36 
 
 
340 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  42.28 
 
 
363 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  45.77 
 
 
353 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  39.16 
 
 
350 aa  193  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  41.79 
 
 
336 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.32 
 
 
358 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  44.05 
 
 
368 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  40.76 
 
 
354 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  42.42 
 
 
322 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  45.05 
 
 
334 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  45.05 
 
 
334 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  45.03 
 
 
353 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  38.79 
 
 
333 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  43.07 
 
 
338 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.39 
 
 
337 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  41.53 
 
 
348 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.67 
 
 
330 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  41.19 
 
 
354 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3911  transport system permease protein  52.11 
 
 
289 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000192945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  42.28 
 
 
343 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  41.05 
 
 
337 aa  186  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.56 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.11 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  40.14 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  41.87 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  38.42 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.84 
 
 
315 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.81 
 
 
370 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  38.6 
 
 
341 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  45.96 
 
 
361 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.89 
 
 
380 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  40.55 
 
 
345 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  42.37 
 
 
323 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  43.6 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  43.34 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  38.82 
 
 
368 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  41.75 
 
 
351 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  41.88 
 
 
343 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.65 
 
 
367 aa  179  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.95 
 
 
315 aa  179  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 
335 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  41.41 
 
 
347 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  39.18 
 
 
351 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  41.77 
 
 
344 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  36.17 
 
 
343 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  41.7 
 
 
345 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  35.23 
 
 
343 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  40.71 
 
 
376 aa  176  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  41.51 
 
 
327 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4031  transport system permease protein  43.12 
 
 
325 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  41.95 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  43.29 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.92 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  39.21 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.1 
 
 
367 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  45.26 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.200312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>