More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2730 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  100 
 
 		 350 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  57.8 
 
 		 353 aa  352  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  58.1 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  60.43 
 
 		 368 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  53.99 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  52.68 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  55.07 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  45.72 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.04 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  51.1 
 
 		 360 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1969  transport system permease protein  52.15 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  45.39 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  45.02 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  50.16 
 
 		 340 aa  233  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0757  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  39.14 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.534132  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  49.55 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  43.8 
 
 		 348 aa  226  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  47.04 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.54 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  42.55 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  48.76 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  47.55 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  43.03 
 
 		 369 aa  219  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  46.01 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  46.1 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  50.72 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  49.37 
 
 		 343 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  47.28 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  46.74 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  51.08 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  38.89 
 
 		 363 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2770  transport system permease protein  46.81 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169159  normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3911  transport system permease protein  52.45 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000192945  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  47.52 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.44 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  38.4 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  45.89 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  51.42 
 
 		 352 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  51.42 
 
 		 352 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  51.42 
 
 		 371 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  51.42 
 
 		 371 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  51.42 
 
 		 371 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.94 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.94 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4492  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 346 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  51.06 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.06 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  44.44 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  48.6 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  42.86 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.89 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  42.77 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  38.94 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  43.71 
 
 		 452 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.37 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  50.71 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.99 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1140  transport system permease protein  41.09 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  39.87 
 
 		 345 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.44 
 
 		 362 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0869  transport system permease protein  49.65 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1350  transport system permease protein  49.65 
 
 		 346 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.27 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  41.3 
 
 		 336 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.19 
 
 		 347 aa  195  9e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  42.51 
 
 		 370 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  41.13 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  42.01 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  48.57 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  40.57 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  47.4 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  37.46 
 
 		 375 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2654  transport system permease protein  48.93 
 
 		 382 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00408489  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  39.47 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  41.74 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  43.31 
 
 		 356 aa  193  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  39.62 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  40 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  40.34 
 
 		 332 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  41.32 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  41.23 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  42.86 
 
 		 354 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  37.5 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  44.37 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  37.5 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.49 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  42.12 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  44.44 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  40.88 
 
 		 347 aa  189  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  42.96 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  40.88 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  35.39 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  43.31 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  40.21 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  36.9 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1427  transport system permease protein  51.44 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3181  transport system permease protein  38.89 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  42.77 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.88 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>