More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2707 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  100 
 
 		 340 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  76.31 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  60.98 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  59.49 
 
 		 356 aa  305  5.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  49.85 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  49.21 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  49.23 
 
 		 346 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  51.24 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  50.94 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  50.17 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  49.38 
 
 		 340 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  48.04 
 
 		 336 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  48.23 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  51.6 
 
 		 335 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  50.16 
 
 		 347 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  48.6 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  50.16 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  53.54 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1361  transport system permease protein  47.75 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2417  transport system permease protein  51.12 
 
 		 339 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3278  transport system permease protein  50.8 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  47.18 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2057  transport system permease protein  53.72 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.441726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1137  transport system permease protein  50.53 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2654  transport system permease protein  51.68 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00408489  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  44.69 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  46.42 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  48.74 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1427  transport system permease protein  51.41 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3391  ABC Fe3+-siderophores transporter, inner membrane subunit  53.26 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.581639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3037  transport system permease protein  53.26 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  41.82 
 
 		 350 aa  232  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  44.71 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.35 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  41.43 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23970  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  49.69 
 
 		 369 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.597722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  47.92 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.71 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  47.85 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  49.82 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  45.2 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  50.71 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.74 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  40.99 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  45.68 
 
 		 346 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  39.89 
 
 		 375 aa  208  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  45.16 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  36.96 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  39.13 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  39.18 
 
 		 352 aa  206  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  39.3 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  40.49 
 
 		 345 aa  205  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  40.12 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  40.12 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  36.68 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  39.53 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  51.25 
 
 		 353 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  44.86 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.01 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  40.12 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.45 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1300  transport system permease protein  51.3 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  45.99 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  33.85 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.53 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  38.55 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  38.79 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  42.37 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  46.24 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  44.55 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  39.75 
 
 		 336 aa  197  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  40.85 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3181  transport system permease protein  40.29 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.73 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  43.21 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  39.1 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  40.48 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  37.78 
 
 		 348 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  37.35 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3911  transport system permease protein  50.88 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000192945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  35.34 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.6 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0841  transport system permease protein  40 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  37.25 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1117  transport system permease protein  43.87 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  43.62 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  45.43 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  41.49 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  41.14 
 
 		 347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  37.28 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.96 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.78 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  42.06 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  41.49 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.38 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0869  transport system permease protein  42.69 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.98 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.07 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>