More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1427 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1427  transport system permease protein  100 
 
 		 364 aa  659    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  55 
 
 		 369 aa  349  5e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23970  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  71.29 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.597722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  59.26 
 
 		 373 aa  298  8e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  54.68 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  53.13 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  51.86 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  50.16 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  53.16 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  44.59 
 
 		 346 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  44.27 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  45.8 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  44.79 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  47.19 
 
 		 352 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  45.45 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2654  transport system permease protein  48.97 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00408489  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  46.55 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  44.31 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  49.06 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  45.25 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  42.11 
 
 		 345 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  46.78 
 
 		 353 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  49.01 
 
 		 361 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.79 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  47.95 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  44.44 
 
 		 346 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  48.09 
 
 		 335 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  44.41 
 
 		 336 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  52.52 
 
 		 350 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  45.92 
 
 		 315 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  44.97 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  48.29 
 
 		 346 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  45.43 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  42.03 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  46.61 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  45.45 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  44.37 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  43.84 
 
 		 371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  46.29 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.67 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  46.51 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  42.01 
 
 		 452 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  41.27 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  44.84 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2417  transport system permease protein  46.98 
 
 		 339 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  43.6 
 
 		 370 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  41.1 
 
 		 361 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3278  transport system permease protein  46.52 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  42.41 
 
 		 352 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  38.14 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  38.64 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.98 
 
 		 337 aa  206  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  47.18 
 
 		 340 aa  205  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  40.72 
 
 		 383 aa  205  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  36.11 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  41.89 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  41.93 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  44.76 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.13 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.13 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  44.72 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  45.55 
 
 		 350 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2057  transport system permease protein  46.35 
 
 		 338 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.441726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  36.34 
 
 		 343 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  49.68 
 
 		 353 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1361  transport system permease protein  43.21 
 
 		 357 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  41.23 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  45.89 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.62 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  43.67 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  45.82 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  35.76 
 
 		 343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  42.77 
 
 		 328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.96 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  42.77 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  34.96 
 
 		 362 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  45.14 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  43.77 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  45.34 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  44.21 
 
 		 361 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  41.82 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.09 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.06 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  38.24 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  37.43 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  42.86 
 
 		 365 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  41.29 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  40.99 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.78 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  43.6 
 
 		 348 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.47 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  34.78 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  37.9 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  41.52 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  42.09 
 
 		 316 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  43.12 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  38.38 
 
 		 342 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.67 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  38.27 
 
 		 375 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>