More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4223 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  100 
 
 		 346 aa  653    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  59.83 
 
 		 346 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  58.96 
 
 		 346 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  60.84 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  59.49 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  57.94 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  57.63 
 
 		 336 aa  351  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  61.02 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  60.7 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  60.77 
 
 		 335 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  57.54 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  56.48 
 
 		 346 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  56.48 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  55.52 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3278  transport system permease protein  57.86 
 
 		 338 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2417  transport system permease protein  57.86 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1137  transport system permease protein  58.39 
 
 		 342 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2057  transport system permease protein  60.51 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.441726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1361  transport system permease protein  57.8 
 
 		 357 aa  312  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  55.79 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3391  ABC Fe3+-siderophores transporter, inner membrane subunit  59.35 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.581639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3037  transport system permease protein  59.35 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  51.39 
 
 		 338 aa  278  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  54.55 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  52.27 
 
 		 356 aa  252  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  45.83 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2654  transport system permease protein  45.71 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00408489  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  44.37 
 
 		 351 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.55 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  42.27 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.51 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  40.5 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.2 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  40.06 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  39.69 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  45.94 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.24 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.43 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  43.9 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  37.27 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  33.43 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23970  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.42 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.597722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  40.81 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  40.48 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  43.73 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  36.11 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.14 
 
 		 315 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  42.81 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.85 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.72 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.52 
 
 		 352 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.2 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  39.31 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  36.55 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  41.05 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  39.68 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  32.93 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  32.34 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  42.61 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  40.21 
 
 		 363 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  38.57 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  37.32 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  36.44 
 
 		 344 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  37.46 
 
 		 348 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  33.95 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  34.13 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  41.05 
 
 		 361 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  32.59 
 
 		 360 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1300  transport system permease protein  46.45 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  36.14 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  37.97 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  36.54 
 
 		 350 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  36.94 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  33.64 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  40.78 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  35.21 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.86 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.86 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 		 380 aa  170  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  35.21 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.09 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  38.08 
 
 		 354 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  34.32 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  40.41 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4031  transport system permease protein  40.73 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.05 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  38.3 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1427  transport system permease protein  42.01 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1117  transport system permease protein  36.89 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  35.24 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.4 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  38.08 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3181  transport system permease protein  36.25 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.23 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  34.5 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  34.9 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  38.85 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  44.27 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>