More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0275 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  100 
 
 		 323 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  74.76 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  75.33 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1461  transport system permease protein  72.14 
 
 		 323 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  69.06 
 
 		 312 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1922  transport system permease protein  77.18 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  59.32 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3756  transport system permease protein  63.18 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4031  transport system permease protein  61.41 
 
 		 325 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2788  transport system permease protein  52.5 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.890347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0996  transport system permease protein  53.99 
 
 		 350 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0655  transport system permease protein  53.25 
 
 		 335 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355285  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2212  transport system permease protein  52.9 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2666  transport system permease protein  53.8 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.616984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2208  transport system permease protein  53.92 
 
 		 339 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2460  transport system permease protein  52.79 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2614  transport system permease protein  53.1 
 
 		 329 aa  235  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3501  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, inner membrane subunit  53.33 
 
 		 336 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2399  transmembrane ABC transporter protein  53.48 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1844  transport system permease protein  53.11 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2455  transport system permease protein  53.11 
 
 		 371 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0835  iron compound ABC transporter, permease protein  53.42 
 
 		 342 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  40.19 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0839  transport system permease protein  53.42 
 
 		 450 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2371  transport system permease protein  53.11 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.23 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2503  transport system permease protein  53.11 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5786  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  52.79 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1189  putative transmembrane ABC transporter permease  53.4 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.501145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1036  cobalamin ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2326  cobalamin ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0686  iron compound ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1029  cobalamin ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0818949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1638  cobalamin ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2960  cobalamin ABC transporter, permease protein  53.07 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  39 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  38.24 
 
 		 367 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  39.88 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  42.91 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.89 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  41.32 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  36.06 
 
 		 336 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  40.12 
 
 		 340 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  40.36 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.91 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  39.01 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  38.12 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  36.36 
 
 		 344 aa  186  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  38.48 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.07 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  40.06 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.51 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  41.09 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.73 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  38.53 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.1 
 
 		 361 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.12 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  35.31 
 
 		 354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  34.12 
 
 		 348 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  36.36 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  37.35 
 
 		 350 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  40.21 
 
 		 357 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  36.51 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.22 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  41.24 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  38.23 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.42 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  38.44 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  40 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  38.36 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  41.02 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.25 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.22 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  39.31 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  42.05 
 
 		 345 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  37.22 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  38.11 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.81 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.13 
 
 		 367 aa  175  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  36.1 
 
 		 369 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  38.01 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  38.92 
 
 		 354 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  37.11 
 
 		 353 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  36.54 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  38.33 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  36.94 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  36.17 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  39.88 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  37.9 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  38.32 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  36.83 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  35.46 
 
 		 360 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  38.69 
 
 		 354 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  35.03 
 
 		 359 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  36.1 
 
 		 329 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  33.65 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  35.35 
 
 		 357 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.41 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  37.28 
 
 		 359 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>