More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3756 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3756  transport system permease protein  100 
 
 
343 aa  634    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4031  transport system permease protein  65.74 
 
 
325 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  64.35 
 
 
322 aa  352  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  63.18 
 
 
323 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1461  transport system permease protein  60.75 
 
 
323 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  63.33 
 
 
322 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  57.28 
 
 
312 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  54.03 
 
 
354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1922  transport system permease protein  63.18 
 
 
353 aa  285  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2788  transport system permease protein  56.59 
 
 
335 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.890347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0655  transport system permease protein  58.52 
 
 
335 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355285  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2460  transport system permease protein  55.7 
 
 
371 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0996  transport system permease protein  53.6 
 
 
350 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2212  transport system permease protein  52.45 
 
 
349 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907416  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1844  transport system permease protein  56.35 
 
 
371 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2455  transport system permease protein  56.35 
 
 
371 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0835  iron compound ABC transporter, permease protein  57.65 
 
 
342 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2614  transport system permease protein  56.45 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2208  transport system permease protein  50.74 
 
 
339 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2666  transport system permease protein  52.47 
 
 
336 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.616984  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1189  putative transmembrane ABC transporter permease  57 
 
 
333 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.501145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2503  transport system permease protein  56.68 
 
 
332 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2371  transport system permease protein  56.68 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2960  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.68 
 
 
333 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0686  iron compound ABC transporter, permease protein  56.68 
 
 
333 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1638  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.68 
 
 
333 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1029  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.68 
 
 
333 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0818949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1036  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.68 
 
 
342 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2326  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.68 
 
 
342 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5786  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  56.03 
 
 
332 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0839  transport system permease protein  56.49 
 
 
450 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3501  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, inner membrane subunit  56.06 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2399  transmembrane ABC transporter protein  51.34 
 
 
335 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  40.39 
 
 
362 aa  208  9e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  42.05 
 
 
333 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  44.56 
 
 
355 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  41.37 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  35.92 
 
 
348 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.49 
 
 
348 aa  195  7e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  43.84 
 
 
315 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  37.46 
 
 
330 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  41.38 
 
 
361 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  35.63 
 
 
348 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.82 
 
 
330 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.37 
 
 
350 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  40.68 
 
 
357 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  38.01 
 
 
349 aa  190  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.36 
 
 
367 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.69 
 
 
350 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  42.81 
 
 
356 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  43.33 
 
 
338 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  36.93 
 
 
336 aa  186  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  39.8 
 
 
315 aa  186  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  41.9 
 
 
363 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  41.84 
 
 
369 aa  185  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  38.65 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.87 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.15 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  41.7 
 
 
363 aa  183  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  43.77 
 
 
340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  40.58 
 
 
346 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 
325 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  41.55 
 
 
334 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  41.55 
 
 
334 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  42.25 
 
 
354 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  37.81 
 
 
345 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  36.86 
 
 
345 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.25 
 
 
358 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  36.66 
 
 
342 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  36.66 
 
 
342 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.16 
 
 
334 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  36.87 
 
 
370 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  40.26 
 
 
346 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
342 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  38.41 
 
 
337 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  40.76 
 
 
340 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  41.26 
 
 
345 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  35.06 
 
 
355 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  41.24 
 
 
330 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  42.29 
 
 
340 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  37.97 
 
 
338 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  37.57 
 
 
351 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  36.56 
 
 
342 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  43.97 
 
 
330 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  38.89 
 
 
357 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
342 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  36.56 
 
 
345 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  36.56 
 
 
345 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  38.52 
 
 
355 aa  176  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  41.24 
 
 
318 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  41.3 
 
 
357 aa  175  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  40.14 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  37.21 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.61 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.14 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  39.03 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  43.73 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  34.63 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>