More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2460 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2460  transport system permease protein  100 
 
 		 371 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1844  transport system permease protein  99.19 
 
 		 371 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2455  transport system permease protein  99.19 
 
 		 371 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5786  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  96.39 
 
 		 332 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2371  transport system permease protein  96.12 
 
 		 339 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2503  transport system permease protein  96.12 
 
 		 332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0839  transport system permease protein  92.95 
 
 		 450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2960  cobalamin ABC transporter, permease protein  82.85 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0686  iron compound ABC transporter, permease protein  82.85 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1638  cobalamin ABC transporter, permease protein  82.85 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0835  iron compound ABC transporter, permease protein  82.58 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1029  cobalamin ABC transporter, permease protein  82.85 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0818949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1036  cobalamin ABC transporter, permease protein  82.85 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2326  cobalamin ABC transporter, permease protein  82.85 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1189  putative transmembrane ABC transporter permease  82.52 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.501145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0996  transport system permease protein  74.04 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2212  transport system permease protein  73.31 
 
 		 349 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3501  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, inner membrane subunit  75.15 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2788  transport system permease protein  57.06 
 
 		 335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.890347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0655  transport system permease protein  60.32 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355285  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2208  transport system permease protein  57.89 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2353 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4031  transport system permease protein  56.44 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  53.87 
 
 		 312 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2666  transport system permease protein  57.28 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.616984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3756  transport system permease protein  56.11 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  56.72 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  55.41 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2399  transmembrane ABC transporter protein  58.82 
 
 		 335 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  52.6 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  50.95 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1922  transport system permease protein  57.28 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1461  transport system permease protein  53.02 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2614  transport system permease protein  53.53 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  39.16 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.34 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  41.32 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  39.19 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  40.28 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  40.82 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  40.53 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.74 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  35.41 
 
 		 350 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  40 
 
 		 340 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.74 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  33.83 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  39.32 
 
 		 351 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.38 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  36.15 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  38.91 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.62 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  34.59 
 
 		 355 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  38.18 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  38.92 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 343 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  43.31 
 
 		 358 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  36.09 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  38.3 
 
 		 368 aa  166  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  37.7 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  37.62 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  35.45 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.14 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.06 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  38.76 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0746  transport system permease protein  45.67 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  hitchhiker  0.0000000000140721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  34.55 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  38.72 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  32 
 
 		 346 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  40.75 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  38.73 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  35.4 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  35.31 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  40.26 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  34.65 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  34.5 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  36.81 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  37.28 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  38.39 
 
 		 356 aa  159  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40 
 
 		 334 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40 
 
 		 334 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40 
 
 		 334 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1121  transport system permease protein  39.93 
 
 		 343 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.5 
 
 		 367 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  35.78 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  39.79 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4799  transport system permease protein  45.49 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000697014  hitchhiker  0.00165127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  38.95 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.15 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  31.43 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  33.85 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  35.55 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  38.38 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  41.58 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  35.51 
 
 		 357 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.77 
 
 		 354 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.63 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 		 366 aa  155  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.16 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  36.45 
 
 		 345 aa  155  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.86 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>