More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1461 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1461  transport system permease protein  100 
 
 		 323 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  78.27 
 
 		 322 aa  448  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  79.14 
 
 		 322 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  74.01 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1922  transport system permease protein  75.08 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  64.29 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3756  transport system permease protein  62.29 
 
 		 343 aa  315  8e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4031  transport system permease protein  60.26 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  55.88 
 
 		 354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2788  transport system permease protein  50.91 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.890347 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2614  transport system permease protein  52.76 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2460  transport system permease protein  53.27 
 
 		 371 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0655  transport system permease protein  53.9 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355285  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0996  transport system permease protein  53.92 
 
 		 350 aa  245  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1844  transport system permease protein  53.77 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2455  transport system permease protein  53.77 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2212  transport system permease protein  52.26 
 
 		 349 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2666  transport system permease protein  53.35 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.616984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3501  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, inner membrane subunit  54.09 
 
 		 336 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2371  transport system permease protein  53.59 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2503  transport system permease protein  53.77 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0839  transport system permease protein  54.25 
 
 		 450 aa  225  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5786  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  53.11 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2208  transport system permease protein  55.28 
 
 		 339 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0835  iron compound ABC transporter, permease protein  52.12 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2399  transmembrane ABC transporter protein  52.15 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1189  putative transmembrane ABC transporter permease  52.61 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.501145  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0686  iron compound ABC transporter, permease protein  52.61 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1029  cobalamin ABC transporter, permease protein  52.61 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0818949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2960  cobalamin ABC transporter, permease protein  52.61 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1036  cobalamin ABC transporter, permease protein  52.61 
 
 		 342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2326  cobalamin ABC transporter, permease protein  52.61 
 
 		 342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1638  cobalamin ABC transporter, permease protein  52.61 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.19 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  40.14 
 
 		 333 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  38.85 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  39.72 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.51 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  42.47 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  40.88 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.76 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  39.86 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.01 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.5 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  43.66 
 
 		 340 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.32 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  38.32 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  39.56 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  42.38 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.94 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  37.84 
 
 		 345 aa  179  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  39.58 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  39.93 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  40 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  40.64 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  38.22 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.87 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  39.12 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  35.74 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.18 
 
 		 358 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.93 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  38.39 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.53 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.39 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  36.45 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40.49 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40.49 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40.49 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.24 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  40.56 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.29 
 
 		 370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  37.54 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  34.38 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  38.89 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  36.69 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.61 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  35.91 
 
 		 370 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  33.94 
 
 		 368 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  39.31 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  33.12 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  37.58 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  37.58 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  37.58 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.55 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.65 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.65 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  35.05 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  37.26 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  43.11 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  36.42 
 
 		 354 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  41.48 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.99 
 
 		 371 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  34.85 
 
 		 348 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  33.43 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1450  transport system permease protein  43.25 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  40.57 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  39.18 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>