More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3911 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3911  transport system permease protein  100 
 
 		 289 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000192945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1969  transport system permease protein  61.81 
 
 		 376 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  52.8 
 
 		 353 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  50.35 
 
 		 346 aa  228  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  49.82 
 
 		 340 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.35 
 
 		 367 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  52.63 
 
 		 350 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  53.33 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  47.83 
 
 		 351 aa  218  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  46.15 
 
 		 369 aa  218  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  50.35 
 
 		 352 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  46.13 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  50.53 
 
 		 340 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  48.46 
 
 		 348 aa  211  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  48.58 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  45.14 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  48.23 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  43.57 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  51.25 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  44.76 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  45.94 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  44.01 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  42.91 
 
 		 346 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  45.49 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  45.07 
 
 		 347 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  48.46 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  45.71 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  41.28 
 
 		 336 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  42.25 
 
 		 332 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  40.07 
 
 		 351 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  44.01 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  44.37 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  52.11 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  48.76 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  41.28 
 
 		 340 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.34 
 
 		 389 aa  191  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  44.95 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  47.35 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  50.71 
 
 		 353 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  49.3 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  41.9 
 
 		 336 aa  188  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  45.55 
 
 		 358 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  40.64 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  45.39 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.74 
 
 		 371 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  38.03 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  45.39 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  43.06 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  37.25 
 
 		 385 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  38.46 
 
 		 345 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  45.39 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  45.39 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  45.39 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  37.23 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  37.58 
 
 		 375 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  45.39 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.88 
 
 		 362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  45.94 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  37.25 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  45.39 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  37.25 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  39.51 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  45.74 
 
 		 366 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  43.31 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  42.11 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  41.26 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  46.64 
 
 		 346 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  43.31 
 
 		 347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  41.2 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0869  transport system permease protein  46.64 
 
 		 346 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1350  transport system permease protein  46.64 
 
 		 346 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2248  transport system permease protein  41.46 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1427  transport system permease protein  48.25 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  36.93 
 
 		 381 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4492  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  46.07 
 
 		 346 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  40.48 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0757  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  37.89 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.534132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  44.86 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  40.48 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3181  transport system permease protein  36.93 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  39.01 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  38.82 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2654  transport system permease protein  45.74 
 
 		 382 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00408489  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  39.36 
 
 		 350 aa  175  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 		 335 aa  175  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.49 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0841  transport system permease protein  36.6 
 
 		 382 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  42.24 
 
 		 346 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  43.21 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  38.93 
 
 		 333 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  36.62 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23970  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.72 
 
 		 369 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.597722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  40.14 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  34.4 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.86 
 
 		 361 aa  171  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.49 
 
 		 356 aa  171  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  36.71 
 
 		 315 aa  171  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  42.27 
 
 		 452 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>