More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4492 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4492  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
346 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476835  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  91.04 
 
 
346 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0869  transport system permease protein  91.33 
 
 
346 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1350  transport system permease protein  91.33 
 
 
346 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  73.31 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  72.68 
 
 
352 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  72.02 
 
 
371 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  71.75 
 
 
371 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  71.75 
 
 
371 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  71.75 
 
 
371 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  72.68 
 
 
352 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  71.75 
 
 
371 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  55.56 
 
 
336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  59.24 
 
 
340 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  52.48 
 
 
346 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  57.32 
 
 
343 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  58.01 
 
 
347 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  58.28 
 
 
343 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  48.56 
 
 
348 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  50.53 
 
 
352 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  50.76 
 
 
327 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  42.12 
 
 
334 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2770  transport system permease protein  49.64 
 
 
328 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169159  normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  50 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  47.29 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.38 
 
 
367 aa  232  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  48.77 
 
 
360 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  52.48 
 
 
341 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  48.93 
 
 
353 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  49.37 
 
 
361 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  42.18 
 
 
381 aa  222  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0185  transport system permease protein  48.39 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0173  transport system permease protein  48.2 
 
 
336 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  38.4 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0546  transport system permease protein  44.44 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  43.37 
 
 
336 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  39.19 
 
 
345 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  48.93 
 
 
350 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.83 
 
 
389 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  44.84 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  48.14 
 
 
353 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  35.52 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  44.89 
 
 
346 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  44.49 
 
 
356 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
380 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  42.16 
 
 
370 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  35.57 
 
 
375 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.43 
 
 
350 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  43.46 
 
 
354 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  42.77 
 
 
354 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  38.72 
 
 
376 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  39.44 
 
 
315 aa  189  7e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  40.9 
 
 
348 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3323  transport system permease protein  49.17 
 
 
343 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  35.28 
 
 
364 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  35 
 
 
385 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  35.28 
 
 
364 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  49.29 
 
 
368 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1117  transport system permease protein  39.46 
 
 
349 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  36.65 
 
 
360 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  43.37 
 
 
338 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  38.41 
 
 
347 aa  185  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.93 
 
 
346 aa  185  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  36.67 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  39.58 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.6 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  45.71 
 
 
356 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.95 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.65 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  40.23 
 
 
371 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  47.86 
 
 
358 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  41.96 
 
 
340 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.65 
 
 
330 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  38.67 
 
 
347 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  43.11 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  36.34 
 
 
338 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  42.4 
 
 
332 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0757  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  37.07 
 
 
355 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.534132  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  35.56 
 
 
369 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  36.84 
 
 
381 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.48 
 
 
362 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0841  transport system permease protein  35.67 
 
 
382 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3181  transport system permease protein  35.96 
 
 
382 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.14 
 
 
336 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  42.51 
 
 
370 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  33.97 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1969  transport system permease protein  43.47 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  39.45 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  40.4 
 
 
361 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  33.21 
 
 
336 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.02 
 
 
368 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  38.41 
 
 
336 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.58 
 
 
363 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  38.11 
 
 
340 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  40.68 
 
 
365 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  36.75 
 
 
316 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  40.43 
 
 
345 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  40.77 
 
 
351 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1140  transport system permease protein  40.4 
 
 
340 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.58 
 
 
363 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>