More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1100 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1016  transport system permease protein  100 
 
 		 360 aa  667    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1100  transport system permease protein  100 
 
 		 360 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1541  transport system permease protein  80.39 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0230541  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4775  transport system permease protein  80 
 
 		 307 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2551  transport system permease protein  67.49 
 
 		 336 aa  338  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2363  transport system permease protein  71.21 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2781  transport system permease protein  70.59 
 
 		 344 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2620  transport system permease protein  62.89 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2793  transport system permease protein  70.3 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473621 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0513  iron ABC transporter, permease protein  49.86 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132048  normal  0.109169 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2663  transport system permease protein  59.86 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2306  Iron(III) dicitrate-binding protein  55.69 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409919  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3078  transport system permease protein  45.45 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0306769  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  37.76 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0230  transport system permease protein  45.3 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.86 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  39.18 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  34.82 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  37.06 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.79 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.44 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  41.59 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  38.31 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.88 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.45 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.3 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.73 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.73 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1117  transport system permease protein  39.32 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  39.75 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  41.24 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  31.16 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.19 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.18 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  30.82 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  36.08 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  37.07 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  36.77 
 
 		 352 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  36.31 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  38.21 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  37.41 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  38.68 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  38.21 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  38.21 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.71 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  36.99 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  40.91 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  38.11 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.51 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  30.16 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.47 
 
 		 354 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  36.64 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  36.31 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  30.27 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  35.57 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  37.59 
 
 		 345 aa  143  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  35.07 
 
 		 337 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.63 
 
 		 452 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  39.93 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  37.5 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  41.5 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1625  vtamin B12-transporter permease  38.41 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  35.49 
 
 		 383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  34.08 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  38.57 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  39.93 
 
 		 348 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  33.67 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  36.61 
 
 		 359 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  36.64 
 
 		 368 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.36 
 
 		 381 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  31.96 
 
 		 373 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  33.91 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  36.99 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  30.42 
 
 		 354 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  38.25 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  34.92 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  40 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  33.33 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  34.92 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  36.39 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  35.42 
 
 		 361 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  32.19 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  37.33 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  37.24 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  34.87 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.58 
 
 		 348 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  33.87 
 
 		 365 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  29.07 
 
 		 343 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  36.96 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  34.81 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  38.62 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.3 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  39.65 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  37.33 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  27.8 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0546  transport system permease protein  37.06 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  38.49 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>