More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24450 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24450  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 		 350 aa  682    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0747  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  48.5 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1257  transport system permease protein  40.41 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0278  transport system permease protein  43.16 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12518  iron(III) ABC transporter, permease protein, putative  38.63 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0343  transport system permease protein  38.41 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0162  transport system permease protein  35.17 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3088  transport system permease protein  34.68 
 
 		 371 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1298  transport system permease protein  35.85 
 
 		 362 aa  192  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0082  transport system permease protein  37.89 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.85435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1004  transport system permease protein  35.85 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00447808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2111  transport system permease protein  33.43 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.453774  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3337  transport system permease protein  34.97 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0671  iron compound ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.170455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  34.83 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0114  transport system permease protein  32.07 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0647  iron compound ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.499721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0278  transport system permease protein  32.61 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0561654  normal  0.124671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  36.9 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3542  transport system permease protein  36.08 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2250  transport system permease protein  36.34 
 
 		 374 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0288275 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0130  transport system permease protein  34.52 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.17857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  32.59 
 
 		 354 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  32.02 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  34.94 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  34.94 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  34.94 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  34.94 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  34.09 
 
 		 326 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  34.35 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  33.54 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  31.31 
 
 		 326 aa  166  8e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  34.98 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1625  vtamin B12-transporter permease  36.33 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  31.56 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  32.9 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  31.06 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  31.06 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  31.06 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  32.39 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  32.87 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  33.33 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35.19 
 
 		 366 aa  159  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  28.49 
 
 		 373 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  31.96 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  30.96 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  34.75 
 
 		 356 aa  159  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  30.25 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  32.75 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  31.33 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1654  vtamin B12-transporter permease  33.44 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  34.37 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1791  vtamin B12-transporter permease  34.09 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.979653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1920  vtamin B12-transporter permease  34.09 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  30.7 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01680  vtamin B12-transporter permease  34.43 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1931  transport system permease protein  34.43 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00205827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1479  vtamin B12-transporter permease  34.43 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.950653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01669  hypothetical protein  34.43 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.028051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  31.25 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1930  vtamin B12-transporter permease  34.43 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2429  vtamin B12-transporter permease  34.31 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  31.35 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  34.19 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  30.42 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  32.7 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  33.92 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  30.79 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  33.57 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  32.7 
 
 		 356 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1915  vtamin B12-transporter permease  33.77 
 
 		 326 aa  153  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  30.23 
 
 		 362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  29.63 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  35.86 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  36.45 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  30.81 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2775  vtamin B12-transporter permease  30.74 
 
 		 345 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.574344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  29.19 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  31.03 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  29.19 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  29.19 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  33.92 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  34.18 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  30.7 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  33.24 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  29.71 
 
 		 331 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.22 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  30.72 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  32.52 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  33.44 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  32.08 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2469  vtamin B12-transporter permease  31.9 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  31.36 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  28.57 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  33.33 
 
 		 367 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  30.11 
 
 		 366 aa  150  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  31.39 
 
 		 328 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  27.65 
 
 		 355 aa  149  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>