More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1232 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1232  transport system permease protein  100 
 
 		 339 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2523  ferric ion ABC transpoter (permease)  78.78 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.507861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1450  transport system permease protein  61.85 
 
 		 347 aa  329  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  62.27 
 
 		 346 aa  316  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  58.49 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  58.04 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8854  transport system permease protein  56.65 
 
 		 453 aa  285  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  55.09 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0219  transport system permease protein  62.87 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.336613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28060  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  61.94 
 
 		 355 aa  235  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  43.07 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  42.63 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  44.95 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.29 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  42.47 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  37.77 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  40.7 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  36.75 
 
 		 353 aa  202  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.88 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.88 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  41.58 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.53 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  37.69 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.77 
 
 		 358 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.04 
 
 		 354 aa  199  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  32.48 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  40.24 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.1 
 
 		 334 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.06 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  42.71 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.87 
 
 		 359 aa  185  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  36.01 
 
 		 345 aa  185  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  41.69 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  37.28 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  41.98 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.72 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  43.46 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  39.73 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.06 
 
 		 367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.72 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  36.63 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  33.53 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3078  transport system permease protein  45.27 
 
 		 347 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0306769  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  39.32 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  31.96 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  39.3 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  39.78 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.29 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.17 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  37.5 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  42.45 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  35.05 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  31.09 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  39.93 
 
 		 347 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  37.68 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  38.46 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  40.85 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  39.77 
 
 		 354 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  35.71 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.96 
 
 		 367 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  37.27 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  35.71 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  35.71 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  38.13 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  37.77 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.93 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  35.54 
 
 		 350 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  31.87 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  41.84 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  38.46 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  36.47 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  37.77 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  37.77 
 
 		 342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  35.51 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  39.66 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  39.93 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  37.61 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  40.85 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  38.63 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  41.32 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 		 338 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  45.74 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0230  transport system permease protein  42.27 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.83 
 
 		 332 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  38.97 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  42.55 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.13 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  41.58 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  41.64 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  39.19 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  42.12 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  38.24 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  41.32 
 
 		 367 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  41.52 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>