More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0497 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
354 aa  697    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  55.56 
 
 
344 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  57.19 
 
 
369 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  57.96 
 
 
339 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  57.54 
 
 
343 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  56.94 
 
 
354 aa  362  4e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  55.18 
 
 
350 aa  339  5e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  53.47 
 
 
349 aa  332  9e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  53.16 
 
 
349 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  44.35 
 
 
350 aa  323  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  47.31 
 
 
372 aa  322  9.000000000000001e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  49.68 
 
 
336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  49.85 
 
 
338 aa  311  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  50.62 
 
 
332 aa  309  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  45.62 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  50 
 
 
341 aa  305  6e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  50.62 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  49.85 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  50.31 
 
 
349 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.86 
 
 
362 aa  299  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  50.32 
 
 
349 aa  299  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  44.84 
 
 
344 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  42.53 
 
 
356 aa  289  6e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  47.57 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  48.61 
 
 
340 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  46.74 
 
 
359 aa  279  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  50.8 
 
 
353 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  43.24 
 
 
340 aa  277  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  44.62 
 
 
335 aa  277  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  44.28 
 
 
326 aa  277  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  47.94 
 
 
334 aa  276  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  44.38 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  50.16 
 
 
332 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  45.54 
 
 
341 aa  272  6e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  45.4 
 
 
336 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.23 
 
 
358 aa  271  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  46.18 
 
 
327 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  46.18 
 
 
327 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  43.08 
 
 
347 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  45.74 
 
 
340 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  42.39 
 
 
336 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  43.32 
 
 
338 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  43.27 
 
 
341 aa  257  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  40.85 
 
 
348 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  40.77 
 
 
347 aa  255  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  42.51 
 
 
345 aa  255  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  48.43 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  41.71 
 
 
367 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  47.92 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  43.95 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  47.37 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  46.98 
 
 
339 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.48 
 
 
351 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  43.75 
 
 
339 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  47.04 
 
 
338 aa  247  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  45.76 
 
 
358 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  46.47 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  45.74 
 
 
333 aa  241  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
359 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  46.71 
 
 
326 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  42.3 
 
 
356 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  49.67 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  41.85 
 
 
341 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  43.08 
 
 
337 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  40.94 
 
 
324 aa  239  8e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  39.7 
 
 
348 aa  239  8e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  46.26 
 
 
346 aa  238  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  37.98 
 
 
363 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  42.9 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  43.73 
 
 
332 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  41.9 
 
 
349 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  46.26 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  42.99 
 
 
324 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  39.31 
 
 
337 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  41.74 
 
 
342 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  42.51 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  42.63 
 
 
363 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  40.43 
 
 
330 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  40.78 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  46.47 
 
 
350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  41.27 
 
 
354 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.86 
 
 
334 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.86 
 
 
334 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  39.87 
 
 
339 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  42.44 
 
 
335 aa  216  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.11 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  42.4 
 
 
315 aa  212  7e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.04 
 
 
361 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  45.39 
 
 
341 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  45.39 
 
 
327 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  43.3 
 
 
383 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.43 
 
 
315 aa  205  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  37.62 
 
 
387 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  38.36 
 
 
358 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  39.94 
 
 
326 aa  202  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  39.45 
 
 
350 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  39.46 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  36.06 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  43.3 
 
 
362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  36.06 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>