More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0796 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0796  transport system permease protein  100 
 
 		 296 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2311  transport system permease protein  65.54 
 
 		 351 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1497  transport system permease protein  63.46 
 
 		 387 aa  267  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  57.97 
 
 		 359 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  54.08 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  52.38 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  43.24 
 
 		 355 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  43.34 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  40.61 
 
 		 350 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.64 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.35 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.98 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  41.24 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  45.92 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  43.39 
 
 		 380 aa  178  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.92 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  38.72 
 
 		 368 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  40.34 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.78 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  34.6 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.06 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.06 
 
 		 363 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  42.96 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  33.9 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  40.68 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.54 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.7 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.92 
 
 		 367 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  42.03 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  39.66 
 
 		 346 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  36.73 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  33.91 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  35.69 
 
 		 347 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  36.52 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  34.26 
 
 		 322 aa  168  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  40.14 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  41.36 
 
 		 347 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  42.23 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  42.86 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  36.36 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  38.46 
 
 		 336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  39.46 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  34.6 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  41.16 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  39.66 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  36.18 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.1 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.1 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  37.8 
 
 		 350 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  41.89 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  43.1 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.2 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  42.62 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  40.14 
 
 		 316 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  34.93 
 
 		 346 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.09 
 
 		 347 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.42 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  37.75 
 
 		 368 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.5 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  43.54 
 
 		 334 aa  161  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  35.03 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  40.46 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  40.46 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  38.31 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  36.86 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.07 
 
 		 372 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  38.57 
 
 		 381 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  36.36 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  42.95 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2417  transport system permease protein  41.75 
 
 		 339 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  37.97 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  39.73 
 
 		 325 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  31.53 
 
 		 359 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  38.21 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.12 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  37.76 
 
 		 346 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  32.65 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  39.13 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3278  transport system permease protein  41.08 
 
 		 338 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  41.64 
 
 		 366 aa  158  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  40.6 
 
 		 338 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  43.49 
 
 		 346 aa  158  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  38.98 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  37.97 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  41.55 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  41.84 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1450  transport system permease protein  45.24 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  38.82 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  35.62 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  39.26 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  35.11 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0841  transport system permease protein  40.19 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.73 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  39.8 
 
 		 346 aa  156  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 		 356 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  42.42 
 
 		 363 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  36.48 
 
 		 375 aa  155  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>