More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1497 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1497  transport system permease protein  100 
 
 		 387 aa  714    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2311  transport system permease protein  66.77 
 
 		 351 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  63.09 
 
 		 359 aa  329  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0796  transport system permease protein  63.73 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  52.14 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  50 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  50.34 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  43.34 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  42.3 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.39 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.6 
 
 		 367 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  38.85 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  37.21 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  36.84 
 
 		 343 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  42.09 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  36.68 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  34.07 
 
 		 346 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  36.84 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.31 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  37.77 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.46 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.65 
 
 		 330 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  36.34 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  42.03 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  35.83 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  33.06 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  31.84 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  39.2 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0526  transport system permease protein  43.99 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.07 
 
 		 315 aa  176  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  41.46 
 
 		 363 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.86 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  39.66 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  35.28 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  34.19 
 
 		 336 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  35.04 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  36.36 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  34.13 
 
 		 361 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  35.01 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  42.57 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  41.8 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  36.07 
 
 		 348 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  32.98 
 
 		 356 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  40.79 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  44.61 
 
 		 334 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.66 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.66 
 
 		 452 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  38.11 
 
 		 368 aa  170  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  39.94 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  37.86 
 
 		 365 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  41.41 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  36.73 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.37 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  42.76 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  35.73 
 
 		 333 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  38.67 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  39.76 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  36.79 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  38.1 
 
 		 347 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  35.67 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0534  transport system permease protein  31.86 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.19 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  40.41 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  41.1 
 
 		 347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  33.33 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  35.14 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  33.92 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  37.83 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  34.52 
 
 		 328 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  34.88 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  38.51 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  40.45 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  40.46 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  39.74 
 
 		 325 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  36.67 
 
 		 348 aa  163  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  39.26 
 
 		 338 aa  163  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  38.76 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  41.69 
 
 		 354 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0841  transport system permease protein  36.67 
 
 		 382 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  38.51 
 
 		 364 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40.82 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40.82 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40.82 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  36 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  38.51 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  38.85 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  37.38 
 
 		 337 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  41.69 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  39.47 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  38.72 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  34.97 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  36.39 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  37.14 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2770  transport system permease protein  43.24 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169159  normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.55 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  37.75 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  39.04 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>