More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2075 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  100 
 
 		 333 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  89.79 
 
 		 356 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  63.38 
 
 		 348 aa  394  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  57.81 
 
 		 337 aa  352  7e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  50.3 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  50.3 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.27 
 
 		 351 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  54.17 
 
 		 341 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  53.67 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  48.73 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  49.85 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  53.73 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  52.02 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  49.54 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  49.22 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  46.82 
 
 		 341 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  45.9 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  43.3 
 
 		 369 aa  248  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  43.47 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  44.68 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  43.25 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  44.65 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  42.9 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  41.18 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.49 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  43.17 
 
 		 372 aa  228  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  39.56 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  46.5 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  42.58 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  47.48 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  45 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  42.41 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  42.94 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  42.41 
 
 		 336 aa  222  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  38.96 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  41.19 
 
 		 336 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  42.15 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  40.87 
 
 		 359 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  43.31 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  42.14 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  40.85 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  43.66 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  40.26 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  44.44 
 
 		 349 aa  211  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  43.98 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.79 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.14 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  40.89 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  42.98 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  40.75 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  44.41 
 
 		 349 aa  205  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  40.87 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  37.92 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  46.2 
 
 		 332 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.99 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  42.98 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  35.53 
 
 		 347 aa  199  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  38.85 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  46.58 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  38.56 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  44.34 
 
 		 353 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  37.39 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  43.55 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  38.89 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  40.25 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  38.78 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  46.18 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  38.78 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  46.08 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  40.19 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  47.16 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  43.49 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.45 
 
 		 367 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  38.48 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  40.13 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.83 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.93 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  38.63 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.47 
 
 		 358 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  36.86 
 
 		 369 aa  169  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.79 
 
 		 330 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  39.29 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  37.5 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  38.39 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  36.01 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  39.72 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  38.87 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  36.94 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.79 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.28 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.36 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  37 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  34.85 
 
 		 452 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>