More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1202 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  100 
 
 		 326 aa  629  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  43.83 
 
 		 369 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  44.85 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  47.12 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  48.21 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  43.77 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  43.36 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  40.95 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  44.16 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39 
 
 		 359 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  41.81 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  45.25 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  46.79 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  40.77 
 
 		 356 aa  232  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.35 
 
 		 338 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  44.23 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  44.23 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.22 
 
 		 362 aa  228  7e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  43.17 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  39.57 
 
 		 347 aa  225  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  45.25 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  43.93 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  40.95 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  44.98 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  46.26 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  43.09 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  42.6 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  41.22 
 
 		 347 aa  222  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  42.81 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  41.91 
 
 		 337 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  45.33 
 
 		 349 aa  218  7.999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  43.79 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  39.8 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  47.33 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  44.44 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.41 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.86 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  42.86 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  43.94 
 
 		 356 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  38.54 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  38.46 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  39.7 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  44.32 
 
 		 341 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  42.01 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  38.79 
 
 		 345 aa  205  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  43.53 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  37.54 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  39.3 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  43.66 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  41.67 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  41.75 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  40.74 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  41.75 
 
 		 349 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  41.51 
 
 		 353 aa  198  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  42.12 
 
 		 339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  47.6 
 
 		 338 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  43 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.21 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  38.87 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  41.52 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  40.88 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  41.83 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  43.43 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  45.52 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  40.21 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  38.34 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  41.18 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.24 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  35.31 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  39.79 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  44.93 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  38.91 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  38.91 
 
 		 327 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  38.65 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.91 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  33.96 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  41.64 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.79 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  40.92 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  38.08 
 
 		 346 aa  172  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  34.04 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  35.86 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.78 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  40.43 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  38.08 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  35.59 
 
 		 355 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  41.67 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  44.33 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  35.14 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  36.69 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  35.05 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.31 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.07 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  34.86 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  34.51 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.25 
 
 		 368 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  37.54 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  34.75 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>