More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2064 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  100 
 
 		 338 aa  652    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  55.31 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  55.79 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  52.2 
 
 		 351 aa  322  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  48.95 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  48.95 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  53.08 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  46.53 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  48.08 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  49.85 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  52.02 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  48.3 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  45.31 
 
 		 336 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  49.47 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.1 
 
 		 338 aa  261  8.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  44.71 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  44.14 
 
 		 344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  43.94 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  44.65 
 
 		 369 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  46.93 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  47.15 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  46.06 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  45.31 
 
 		 339 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  44.18 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.13 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  40 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  43.82 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  48.76 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.15 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  43.17 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  45.31 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  45.14 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  43.32 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  48.44 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  44.06 
 
 		 336 aa  229  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  41.1 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  44.94 
 
 		 342 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  42.81 
 
 		 372 aa  228  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  43.2 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  40.26 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  47.69 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  42.9 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  42.43 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39.18 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  47.6 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  41.69 
 
 		 368 aa  219  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  40 
 
 		 341 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  42.11 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  40.18 
 
 		 340 aa  215  9e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  41.56 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  41.56 
 
 		 349 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  41.96 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  45.55 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  43.2 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  38.87 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  43.55 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  43.16 
 
 		 358 aa  205  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  42.76 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  45.62 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  38.24 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  44.29 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  38.89 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  44.44 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  40.45 
 
 		 349 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  41.56 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  41.96 
 
 		 324 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  44.24 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  40.85 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  42.63 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  38.05 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  40.37 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  41.48 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  40.56 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  39.23 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.01 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  41.87 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.86 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  40.62 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  36.88 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  35.94 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  36.93 
 
 		 348 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  38.38 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  40.43 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  33.62 
 
 		 348 aa  165  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.93 
 
 		 361 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.18 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  31.25 
 
 		 330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.15 
 
 		 373 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  34.88 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  34.76 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  36.2 
 
 		 355 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  33.93 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  36.27 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  34.87 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.78 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  37.29 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  37.94 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>