39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1180 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1180  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 507 aa  1028    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4219  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 685 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0449  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 711 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  23.23 
 
 		 624 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  23.54 
 
 		 605 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  21.22 
 
 		 521 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0791  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 653 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  21.38 
 
 		 784 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 778 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2374  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.66 
 
 		 230 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  22.64 
 
 		 727 aa  50.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 468 aa  50.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 563 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.274644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.4 
 
 		 734 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.86 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  22.33 
 
 		 726 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  24.14 
 
 		 474 aa  48.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1010  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 599 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  22.56 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  22.42 
 
 		 211 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 731 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.48 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 220 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 220 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 229 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.4 
 
 		 711 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0342  protein-tyrosine kinase  21.11 
 
 		 554 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0461311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  25.09 
 
 		 800 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.28 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.39 
 
 		 745 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  22.39 
 
 		 464 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 315 aa  44.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  19.07 
 
 		 794 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  21.64 
 
 		 790 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.59 
 
 		 482 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 804 aa  43.9  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 653 aa  43.9  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  25.95 
 
 		 477 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1011  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 464 aa  43.5  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>