More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3578 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3578  diguanylate cyclase  100 
 
 		 367 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2374  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.52 
 
 		 229 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3583  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.49 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000864033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2758  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.07 
 
 		 698 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0530  response regulator receiver protein  30.37 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143294  normal  0.0713478 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3203  diguanylate cyclase  25.69 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0987619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1612  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.07 
 
 		 537 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0726  diguanylate cyclase  27.03 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.914342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  26.21 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02241  hypothetical protein  24.4 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003519  diguanylate cyclase (GGDEF domain) with PAS/PAC sensor  24.4 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000133532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2880  GGDEF  32.79 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.16195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0532  GGDEF domain-containing protein  25.82 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4141  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.07 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  25.53 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  25.43 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0569  sensory box/GGDEF family protein  28.93 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  26.56 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32350  diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  30.22 
 
 		 628 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.32989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  26.09 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3794  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.807786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0531  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.842524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3737  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0621  diguanylate cyclase  24.87 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.13 
 
 		 755 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  25.13 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  24.88 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3920  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00763336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7026  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.398098  hitchhiker  0.000000633587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  30 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5789  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.55 
 
 		 841 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.992809  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1536  diguanylate cyclase  26.01 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3459  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0570  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  28 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0571  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0652  diguanylate cyclase  28.32 
 
 		 280 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3576  diguanylate cyclase  26.2 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  25.27 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  24.53 
 
 		 593 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4400  diguanylate cyclase  27.88 
 
 		 681 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.118889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  29.25 
 
 		 599 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3577  GGDEF domain-containing protein  27.75 
 
 		 322 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2695  hypothetical protein  25.57 
 
 		 835 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.49 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2092  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.61 
 
 		 545 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.403433  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  25.52 
 
 		 485 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  25.77 
 
 		 485 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  26.71 
 
 		 619 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2940  sensor diguanylate cyclase  27.87 
 
 		 571 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1304  diguanylate cyclase  32.52 
 
 		 559 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1232  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.81 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2723  diguanylate cyclase  25.41 
 
 		 627 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000220491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1272  diguanylate cyclase  28.11 
 
 		 632 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0623275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 486 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  30.65 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  25.41 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3512  diguanylate cyclase  25.52 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0265  diguanylate cyclase  25.54 
 
 		 456 aa  54.3  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  25.54 
 
 		 554 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  28.42 
 
 		 548 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  27.32 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0249  hypothetical protein  28.46 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0695  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.46 
 
 		 637 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1797  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.14 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.504833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  27.53 
 
 		 355 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  25 
 
 		 738 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  27.22 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1949  diguanylate cyclase  27.65 
 
 		 733 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0057  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.36 
 
 		 550 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  23.73 
 
 		 458 aa  54.3  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0164  diguanylate cyclase  29.38 
 
 		 437 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.890841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3306  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 324 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198506  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0579  diguanylate cyclase  26.55 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  21.7 
 
 		 411 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2656  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.14 
 
 		 696 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.14 
 
 		 696 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  22.34 
 
 		 550 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  22.16 
 
 		 458 aa  53.5  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  24.69 
 
 		 485 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  27.75 
 
 		 493 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 		 483 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.01 
 
 		 880 aa  53.1  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3264  diguanylate cyclase  27.01 
 
 		 375 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.01 
 
 		 860 aa  53.1  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2157  diguanylate cyclase  26.89 
 
 		 559 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  hitchhiker  0.000000586134 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0214  diguanylate cyclase  24.84 
 
 		 362 aa  53.1  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4028  diguanylate cyclase  24.71 
 
 		 447 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  29.79 
 
 		 803 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5509  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.86 
 
 		 326 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02110  GGDEF domain-containing protein  27.69 
 
 		 235 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.594222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>