85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4043 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  93.45 
 
 		 229 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.34 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4007  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.76 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  28.24 
 
 		 505 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  28.81 
 
 		 529 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.11 
 
 		 482 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  27.68 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  28.07 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  27.98 
 
 		 496 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  27.39 
 
 		 521 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.73 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  29 
 
 		 484 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  24.11 
 
 		 464 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  28.07 
 
 		 466 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 524 aa  68.9  0.00000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 		 480 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  50 
 
 		 445 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 		 667 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  25.33 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  29.73 
 
 		 492 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  24.9 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  28.18 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  27.27 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  24.37 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  24.48 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  23.27 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  24.75 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2374  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  22.73 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  22.03 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3578  diguanylate cyclase  28.02 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  23.81 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.41 
 
 		 463 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  41.18 
 
 		 711 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  25.41 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  39.47 
 
 		 804 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  29.6 
 
 		 525 aa  52.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  26.38 
 
 		 497 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  28.88 
 
 		 438 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  25.34 
 
 		 454 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  41.51 
 
 		 741 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  23.11 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  26.43 
 
 		 509 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  31.79 
 
 		 605 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  39.62 
 
 		 743 aa  48.5  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.77 
 
 		 474 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  36.11 
 
 		 779 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  43.48 
 
 		 753 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  36.11 
 
 		 730 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  27.34 
 
 		 753 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.12 
 
 		 431 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  31.82 
 
 		 743 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 468 aa  45.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  24.62 
 
 		 473 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1820  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00000660961  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 		 488 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.82 
 
 		 671 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0449  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.71 
 
 		 711 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  25.34 
 
 		 615 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  34.62 
 
 		 624 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  38.89 
 
 		 721 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.15 
 
 		 739 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  32.05 
 
 		 736 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0791  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.18 
 
 		 653 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  30.14 
 
 		 872 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  40.74 
 
 		 790 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  31.15 
 
 		 741 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  42.22 
 
 		 739 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  36.36 
 
 		 756 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  36.96 
 
 		 774 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  33.7 
 
 		 734 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  27.01 
 
 		 737 aa  41.6  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>