More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0449 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4219  lipopolysaccharide biosynthesis protein  72.57 
 
 		 685 aa  956    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0449  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 711 aa  1425    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0791  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.73 
 
 		 653 aa  331  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.86 
 
 		 575 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  27.41 
 
 		 624 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  27.35 
 
 		 605 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  27.99 
 
 		 741 aa  98.2  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  31.82 
 
 		 463 aa  96.3  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  26.11 
 
 		 727 aa  95.1  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  35.23 
 
 		 211 aa  95.1  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  24.65 
 
 		 464 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  28.16 
 
 		 734 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  27.7 
 
 		 730 aa  92  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2447  capsular exopolysaccharide family  31.77 
 
 		 278 aa  91.3  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.23 
 
 		 779 aa  90.9  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  26.99 
 
 		 737 aa  90.1  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  30.73 
 
 		 233 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  30.21 
 
 		 233 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  30.73 
 
 		 233 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  29.17 
 
 		 225 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.93 
 
 		 234 aa  88.6  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.5 
 
 		 731 aa  88.6  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  30.21 
 
 		 233 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  30.21 
 
 		 233 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  29.32 
 
 		 753 aa  87.4  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.79 
 
 		 739 aa  87.4  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  34.2 
 
 		 233 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  30.21 
 
 		 246 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  28.24 
 
 		 225 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  26.61 
 
 		 257 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  26.18 
 
 		 750 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  29.63 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  27.78 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.78 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  24.93 
 
 		 743 aa  84.7  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  25.8 
 
 		 742 aa  84  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.11 
 
 		 724 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.26 
 
 		 736 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  27.31 
 
 		 225 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 804 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  27.35 
 
 		 738 aa  82.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  27.4 
 
 		 756 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  24.92 
 
 		 726 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.98 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.14 
 
 		 720 aa  80.9  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.6 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  33.68 
 
 		 224 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  27.57 
 
 		 503 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.45 
 
 		 745 aa  80.5  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  27.84 
 
 		 743 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  26.98 
 
 		 755 aa  79.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  24.42 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.56 
 
 		 228 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4516  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 740 aa  78.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265427  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.56 
 
 		 228 aa  79  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  26.45 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  26.36 
 
 		 772 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  24.17 
 
 		 726 aa  77.8  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  26.83 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  28.12 
 
 		 232 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  28.73 
 
 		 733 aa  76.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  26.71 
 
 		 741 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  26.01 
 
 		 741 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  25.61 
 
 		 727 aa  75.1  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  29.08 
 
 		 803 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  25.94 
 
 		 722 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  27.18 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  21.79 
 
 		 735 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  22.58 
 
 		 721 aa  73.9  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0861  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 		 536 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  23.38 
 
 		 720 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 240 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  27.55 
 
 		 803 aa  73.6  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  25 
 
 		 667 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  25.82 
 
 		 756 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  23.1 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  23.1 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  24.71 
 
 		 801 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  23.1 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.19 
 
 		 790 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  29.38 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.29 
 
 		 242 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  23.1 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  25.3 
 
 		 727 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  22.82 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.77 
 
 		 215 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  26.52 
 
 		 252 aa  72  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  25.37 
 
 		 735 aa  72  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  23.51 
 
 		 753 aa  71.6  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.81 
 
 		 711 aa  71.6  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.57 
 
 		 720 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  21.16 
 
 		 753 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  28.44 
 
 		 615 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  24.64 
 
 		 492 aa  70.1  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  27.18 
 
 		 490 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 751 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  22.82 
 
 		 720 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  25 
 
 		 684 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  30.98 
 
 		 774 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  22.82 
 
 		 720 aa  69.7  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>