72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4007 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4007  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.24 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  44.76 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.23 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  27.15 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  27.6 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  26.24 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  26.91 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  27.95 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.44 
 
 		 482 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  24.55 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  29.28 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  27.85 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  26.01 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  24.17 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  26.24 
 
 		 505 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  25.93 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  23.89 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  28.76 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  26.43 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  26.43 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  24.77 
 
 		 508 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  27.65 
 
 		 503 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  23.11 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.31 
 
 		 463 aa  55.1  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  26.61 
 
 		 466 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  27.88 
 
 		 615 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  26.38 
 
 		 521 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  28.12 
 
 		 484 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  28.9 
 
 		 473 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  26.34 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  23.31 
 
 		 529 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  27.4 
 
 		 474 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  41.54 
 
 		 738 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.66 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  36.36 
 
 		 711 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.62 
 
 		 720 aa  46.2  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  47.06 
 
 		 804 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  25.35 
 
 		 525 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 		 480 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 297 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  39.22 
 
 		 445 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 		 730 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  29.69 
 
 		 746 aa  45.1  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  24.22 
 
 		 490 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  43.48 
 
 		 721 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.29 
 
 		 474 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  39.39 
 
 		 750 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  43.28 
 
 		 753 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  36.76 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  27.4 
 
 		 472 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 		 431 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  32.81 
 
 		 743 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 		 745 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  33.33 
 
 		 475 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  31.25 
 
 		 741 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  37.5 
 
 		 741 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  26.15 
 
 		 472 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  24.22 
 
 		 438 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.08 
 
 		 671 aa  42  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  32.43 
 
 		 779 aa  41.6  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>