267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2880 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
487 aa  978    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  50.96 
 
 
477 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  50.53 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  34.53 
 
 
509 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 
642 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
643 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3715  lipopolysaccharide biosynthesis  24.75 
 
 
712 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.36 
 
 
806 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  22.72 
 
 
466 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 
804 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  25.19 
 
 
756 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.17 
 
 
711 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  25.56 
 
 
518 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.93 
 
 
790 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 
499 aa  99.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.31 
 
 
734 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.81 
 
 
741 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
474 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  25.55 
 
 
514 aa  97.4  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  25.67 
 
 
753 aa  96.7  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.28 
 
 
779 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 
439 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  0.0655667 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 
463 aa  94  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 
730 aa  93.2  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.69 
 
 
743 aa  90.5  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  23.71 
 
 
738 aa  89  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  24.58 
 
 
469 aa  88.2  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 
507 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  22.8 
 
 
662 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.03 
 
 
720 aa  87  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  26.98 
 
 
445 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.36 
 
 
742 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  22.6 
 
 
662 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  26.58 
 
 
517 aa  84.7  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  23 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1960  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
704 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38724  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  20.75 
 
 
475 aa  83.6  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.97 
 
 
750 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  23.38 
 
 
490 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
530 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  24.33 
 
 
756 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  23.87 
 
 
530 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  22.31 
 
 
519 aa  81.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  24.93 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  22.03 
 
 
737 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  23.28 
 
 
499 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.66 
 
 
741 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  24.3 
 
 
770 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.24 
 
 
653 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.55 
 
 
745 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  23.26 
 
 
528 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  21.59 
 
 
736 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0243  lipopolysaccharide biosynthesis  21.17 
 
 
463 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
467 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.15 
 
 
721 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.43 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  23.82 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  22.27 
 
 
722 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.58 
 
 
737 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 
664 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23.52 
 
 
741 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  23.89 
 
 
742 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  26 
 
 
472 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  23.89 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.09 
 
 
741 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  26.09 
 
 
797 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  21.73 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.35 
 
 
872 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  20.42 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  23.95 
 
 
747 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  33.58 
 
 
802 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  24.27 
 
 
772 aa  73.6  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  20.7 
 
 
731 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  21.25 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  21.07 
 
 
750 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  24.38 
 
 
773 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.92 
 
 
671 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  23.18 
 
 
740 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  23.94 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  21.77 
 
 
527 aa  72  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2697  lipopolysaccharide biosynthesis  24.9 
 
 
769 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3304  lipopolysaccharide biosynthesis  20.83 
 
 
663 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  23.61 
 
 
511 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  22.76 
 
 
788 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  22.71 
 
 
533 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  21.54 
 
 
753 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.95 
 
 
739 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  41.89 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 
726 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2463  lipopolysaccharide biosynthesis  22.87 
 
 
713 aa  67  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.718819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  25.49 
 
 
767 aa  67  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  22.59 
 
 
739 aa  66.6  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  21.37 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 
512 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 
724 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  22.86 
 
 
802 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  43.24 
 
 
234 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 
520 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  26.61 
 
 
764 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>