119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02600 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  100 
 
 		 519 aa  1053    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  50.96 
 
 		 527 aa  555  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  41.65 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.99 
 
 		 530 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  36.31 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  34.48 
 
 		 510 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  33.91 
 
 		 533 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  30.88 
 
 		 518 aa  301  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  30.68 
 
 		 511 aa  300  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  34.16 
 
 		 514 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  34.32 
 
 		 514 aa  296  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  32.74 
 
 		 524 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  32.66 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  34.49 
 
 		 480 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  30.51 
 
 		 532 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  28.11 
 
 		 517 aa  226  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  25.54 
 
 		 507 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  25.14 
 
 		 537 aa  163  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  27.15 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  26.4 
 
 		 505 aa  153  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  26.39 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.78 
 
 		 499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  22.73 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  23.37 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0427  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like protein  24.8 
 
 		 521 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0403226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.47 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  23.35 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 		 507 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1927  lipopolysaccharide biosynthesis  27.09 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.81 
 
 		 489 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0831  chain length determinant family protein  23.16 
 
 		 502 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  23.29 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 520 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.5 
 
 		 474 aa  94.4  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 522 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  20.93 
 
 		 499 aa  91.3  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0688  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.6 
 
 		 480 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  22.73 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.06 
 
 		 750 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.03 
 
 		 778 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.88 
 
 		 804 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  22.81 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  22.31 
 
 		 487 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02221  hypothetical protein  22.66 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 575 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  22.75 
 
 		 708 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2885  tyrosine-protein kinase  20.52 
 
 		 767 aa  73.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00159568  normal  0.0841882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  20.76 
 
 		 736 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  23.65 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  23.78 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  23.24 
 
 		 721 aa  63.9  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003540  chain length determinant protein  20.58 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.62 
 
 		 806 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  27.82 
 
 		 759 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  19.75 
 
 		 753 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0360  non-specific protein-tyrosine kinase  21.25 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22.25 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  23.36 
 
 		 711 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.81 
 
 		 734 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.36 
 
 		 601 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  19.63 
 
 		 790 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.16 
 
 		 643 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  18.85 
 
 		 742 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  21.98 
 
 		 753 aa  54.3  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2831  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 456 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370542  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.67 
 
 		 720 aa  53.5  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  18.7 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  20.53 
 
 		 872 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  21.21 
 
 		 802 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  26.35 
 
 		 456 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.618609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.55 
 
 		 642 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.2 
 
 		 734 aa  51.2  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  20.52 
 
 		 747 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  22.63 
 
 		 763 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2409  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 424 aa  50.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.352526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 653 aa  50.8  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2505  exopolysaccharide transport protein family  20.63 
 
 		 735 aa  50.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2736  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 456 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00743206  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  22.96 
 
 		 820 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  20.17 
 
 		 722 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  23.83 
 
 		 727 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 		 759 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2616  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.49 
 
 		 455 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.162079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.22 
 
 		 741 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  21.17 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  20.83 
 
 		 758 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  20.61 
 
 		 727 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 751 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  21.81 
 
 		 731 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0846  lipopolysaccharide biosynthesis  20 
 
 		 488 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.9 
 
 		 751 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  23.43 
 
 		 461 aa  47.4  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>