251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2221 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  100 
 
 
489 aa  988    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.19 
 
 
507 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  40.78 
 
 
499 aa  335  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  39.88 
 
 
499 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  39.83 
 
 
500 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  41.34 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  38.92 
 
 
499 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0831  chain length determinant family protein  42.33 
 
 
502 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0688  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  42.67 
 
 
480 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  34.14 
 
 
518 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  25.2 
 
 
511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.9 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  26.48 
 
 
518 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  24.34 
 
 
510 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  25.77 
 
 
480 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  22.39 
 
 
527 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  25.5 
 
 
517 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  24.35 
 
 
503 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  24.79 
 
 
524 aa  127  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  25.19 
 
 
510 aa  123  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  23.29 
 
 
533 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  22.65 
 
 
519 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  21.9 
 
 
528 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  25.05 
 
 
514 aa  117  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 
530 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
522 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 
520 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  21.98 
 
 
519 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 
493 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 
520 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 
520 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  25.78 
 
 
790 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
519 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  23.9 
 
 
505 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
804 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.45 
 
 
474 aa  90.1  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  24.04 
 
 
532 aa  89.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 
575 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  23.8 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  22.32 
 
 
734 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  23.51 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  23.87 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.16 
 
 
755 aa  77  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.25 
 
 
756 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.83 
 
 
806 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  23.46 
 
 
505 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  22.8 
 
 
472 aa  76.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  24.36 
 
 
741 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  23.15 
 
 
726 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  24.73 
 
 
745 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  20.61 
 
 
726 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2831  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.37 
 
 
734 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  21.58 
 
 
756 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
726 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  24.37 
 
 
745 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.43 
 
 
726 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  23.4 
 
 
724 aa  70.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  24.05 
 
 
709 aa  70.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.3 
 
 
872 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  20.26 
 
 
715 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  18.53 
 
 
731 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  22.64 
 
 
746 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  21.55 
 
 
744 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.88 
 
 
753 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  23.66 
 
 
734 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.35 
 
 
739 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  24.37 
 
 
745 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 
467 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.35 
 
 
739 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0427  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like protein  20.12 
 
 
521 aa  69.3  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0403226 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  22.9 
 
 
740 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  21.15 
 
 
740 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 
724 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  25 
 
 
739 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  21.56 
 
 
747 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  23.58 
 
 
739 aa  67  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  21.57 
 
 
466 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1191  exopolysaccharide transport protein family  23.86 
 
 
750 aa  66.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  26.09 
 
 
746 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  20.83 
 
 
740 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  24.24 
 
 
456 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.618609  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  22.49 
 
 
736 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  21.05 
 
 
743 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 
738 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  20.12 
 
 
763 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  21.65 
 
 
773 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2865  tyrosine kinase  21.05 
 
 
723 aa  64.3  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  24.51 
 
 
746 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  20.82 
 
 
722 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  23.15 
 
 
731 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  21.95 
 
 
736 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  24.51 
 
 
746 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  24.51 
 
 
746 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003540  chain length determinant protein  20.92 
 
 
457 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
761 aa  62  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  22.04 
 
 
755 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>