159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0147 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 
503 aa  1015    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  60.87 
 
 
518 aa  591  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  59.01 
 
 
510 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  57.39 
 
 
514 aa  551  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  41.11 
 
 
511 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  37.75 
 
 
527 aa  350  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  36.31 
 
 
519 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  38.22 
 
 
514 aa  334  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  36.33 
 
 
510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.01 
 
 
530 aa  303  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  33.26 
 
 
528 aa  302  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  34.1 
 
 
524 aa  289  7e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  36.4 
 
 
480 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  34.16 
 
 
533 aa  282  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  32.37 
 
 
517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  31.41 
 
 
532 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  31.37 
 
 
505 aa  213  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  29.29 
 
 
507 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.26 
 
 
493 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1927  lipopolysaccharide biosynthesis  28.23 
 
 
509 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  25.76 
 
 
537 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  25.75 
 
 
499 aa  159  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  26.58 
 
 
505 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  26.41 
 
 
507 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  25.4 
 
 
499 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  25.96 
 
 
490 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.6 
 
 
499 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 
507 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  22.01 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 
512 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.3 
 
 
489 aa  133  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
520 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.85 
 
 
520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 
522 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0831  chain length determinant family protein  24.65 
 
 
502 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 
474 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  24.84 
 
 
500 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0688  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  24.87 
 
 
480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 
520 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0427  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like protein  21.09 
 
 
521 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0403226 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4239  lipopolysaccharide biosynthesis  25.23 
 
 
517 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0553335  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  22.49 
 
 
499 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 
642 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.27 
 
 
643 aa  93.2  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.88 
 
 
575 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 
804 aa  90.5  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 
601 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
519 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
778 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  23.15 
 
 
519 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  24.02 
 
 
508 aa  80.5  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02221  hypothetical protein  21.78 
 
 
475 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  20.06 
 
 
753 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2831  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.08 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370542  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.36 
 
 
653 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  22.99 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  24.86 
 
 
734 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.62 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.63 
 
 
463 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.9 
 
 
720 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003540  chain length determinant protein  22.41 
 
 
457 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  26.2 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  26.18 
 
 
721 aa  67.4  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.41 
 
 
806 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 
477 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.35 
 
 
734 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  25.31 
 
 
456 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.618609  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 
671 aa  64.7  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2736  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 
456 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00743206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  23.05 
 
 
741 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  22.04 
 
 
722 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  20.28 
 
 
759 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 
477 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  22.8 
 
 
472 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  19.8 
 
 
469 aa  60.5  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  22.67 
 
 
779 aa  60.1  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2616  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.63 
 
 
455 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.162079  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  19.58 
 
 
739 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.48 
 
 
750 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  22.8 
 
 
509 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  20.73 
 
 
803 aa  58.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  19.51 
 
 
737 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
422 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  22.02 
 
 
742 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  23.09 
 
 
472 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2286  capsular exopolysaccharide family  25.4 
 
 
784 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.87 
 
 
760 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 
730 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  24.51 
 
 
731 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  20.36 
 
 
820 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  24.06 
 
 
737 aa  55.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  20 
 
 
790 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  21.49 
 
 
795 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  22.57 
 
 
790 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  20.82 
 
 
772 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  21.46 
 
 
727 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.79 
 
 
710 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  21.19 
 
 
738 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  22.39 
 
 
727 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>