177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2398 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 480 aa  958    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  58.64 
 
 		 524 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  51.13 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  47.23 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  44.33 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  42.65 
 
 		 517 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  41.48 
 
 		 533 aa  329  8e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.7 
 
 		 530 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  36.13 
 
 		 527 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  34.26 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5026  chain length determinant family protein  34.67 
 
 		 528 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02600  chain length determinant family protein  34.49 
 
 		 519 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.283305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  36.4 
 
 		 503 aa  266  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  34.79 
 
 		 514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  34.52 
 
 		 510 aa  242  7.999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  30.38 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  29.32 
 
 		 518 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 		 493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  27.05 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  29.06 
 
 		 499 aa  153  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2364  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.48 
 
 		 507 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  27.85 
 
 		 505 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  28 
 
 		 507 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  25.49 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  28 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2221  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  25.05 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.07 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0427  uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis-like protein  26.74 
 
 		 521 aa  136  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0403226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  27.1 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1927  lipopolysaccharide biosynthesis  26.81 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.02 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  28.15 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0688  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  28.25 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1446  lipopolysaccharide biosynthesis  24.64 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.98 
 
 		 520 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.1 
 
 		 474 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 575 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0831  chain length determinant family protein  26.18 
 
 		 502 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 		 487 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 512 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 520 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 520 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 778 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2407  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 601 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 804 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  26.3 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.92 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 		 671 aa  74.3  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 642 aa  73.6  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  22.75 
 
 		 753 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.8 
 
 		 790 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  23.74 
 
 		 806 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0205  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.56 
 
 		 755 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.43 
 
 		 760 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  22.22 
 
 		 750 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 737 aa  67  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2649  lipopolysaccharide biosynthesis  22.42 
 
 		 456 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.618609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2831  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003540  chain length determinant protein  22.96 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 653 aa  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  22.3 
 
 		 739 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 		 710 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02221  hypothetical protein  22.52 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2736  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00743206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3858  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  23.33 
 
 		 795 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  23.34 
 
 		 736 aa  60.1  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  23.26 
 
 		 727 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2616  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.87 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.162079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  24.06 
 
 		 759 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2661  hypothetical protein  21.76 
 
 		 684 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  22.96 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3891  capsular exopolysaccharide family  19.74 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0298  hypothetical protein  21.65 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  23.92 
 
 		 662 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  23.65 
 
 		 662 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  23.02 
 
 		 743 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.28 
 
 		 726 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2701  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 751 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.431033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3557  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 710 aa  56.6  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.1 
 
 		 720 aa  56.6  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.1 
 
 		 734 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  20.69 
 
 		 746 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3415  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 751 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2684  lipopolysaccharide biosynthesis  23.53 
 
 		 742 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0586325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4595  hypothetical protein  24.55 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0587  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 710 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  24.23 
 
 		 763 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  22.06 
 
 		 763 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.32 
 
 		 742 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  20.84 
 
 		 721 aa  53.9  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 738 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  24.62 
 
 		 743 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.09 
 
 		 800 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>