30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4595 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4595  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  940    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2677  hypothetical protein  40.69 
 
 		 465 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3250  hypothetical protein  30.82 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1698  hypothetical protein  30.38 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2009  hypothetical protein  32.43 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2947  hypothetical protein  30.24 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.390818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3794  hypothetical protein  31.08 
 
 		 465 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1428  hypothetical protein  29.8 
 
 		 468 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5174  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.99 
 
 		 686 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  21.78 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.25 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  24.24 
 
 		 753 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 		 642 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  25.29 
 
 		 806 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  21.37 
 
 		 742 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 		 643 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.25 
 
 		 736 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.43 
 
 		 720 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  21.1 
 
 		 741 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  22.1 
 
 		 727 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 738 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  23.17 
 
 		 820 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.17 
 
 		 760 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  20.36 
 
 		 475 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  22.79 
 
 		 478 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  23.96 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  21.69 
 
 		 756 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  20.72 
 
 		 770 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  27.66 
 
 		 509 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>