18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3794 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3794  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  943    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3250  hypothetical protein  45.18 
 
 		 470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1698  hypothetical protein  30.91 
 
 		 468 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1428  hypothetical protein  31.95 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2677  hypothetical protein  30.11 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4595  hypothetical protein  31.08 
 
 		 467 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2947  hypothetical protein  28.41 
 
 		 469 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.390818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2009  hypothetical protein  28.57 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  22.27 
 
 		 763 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5174  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 686 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.46 
 
 		 463 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2908  lipopolysaccharide biosynthesis  22.25 
 
 		 727 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  20.17 
 
 		 750 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.2 
 
 		 671 aa  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  27.09 
 
 		 722 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 778 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>