18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1428 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1428  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  952    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1698  hypothetical protein  63.46 
 
 		 468 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2947  hypothetical protein  63.73 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.390818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2009  hypothetical protein  57.92 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2677  hypothetical protein  34.76 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3250  hypothetical protein  29.38 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3794  hypothetical protein  32.05 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4595  hypothetical protein  29.4 
 
 		 467 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5174  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 686 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.42 
 
 		 742 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  30.33 
 
 		 722 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0240  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.25 
 
 		 760 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0345486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  24.8 
 
 		 731 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  23.62 
 
 		 750 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  28.79 
 
 		 736 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2514  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.26 
 
 		 735 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  24.05 
 
 		 734 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3592  chromosome partitioning ATPase  32.26 
 
 		 735 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.857292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>