16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2677 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2677  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  934    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4595  hypothetical protein  40.69 
 
 
467 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1698  hypothetical protein  37.1 
 
 
468 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625375  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2947  hypothetical protein  36.28 
 
 
469 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.390818  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2009  hypothetical protein  37.76 
 
 
470 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0952635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1428  hypothetical protein  34.76 
 
 
468 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3250  hypothetical protein  30.3 
 
 
470 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3794  hypothetical protein  30.11 
 
 
465 aa  203  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.6 
 
 
736 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5174  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
686 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.22 
 
 
741 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.27 
 
 
734 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  23.11 
 
 
727 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  27.3 
 
 
731 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 
738 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 
463 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>