10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2009 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  950    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1698  hypothetical protein  62.45 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.625375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2947  hypothetical protein  62.18 
 
 		 469 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.390818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1428  hypothetical protein  57.92 
 
 		 468 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2677  hypothetical protein  37.76 
 
 		 465 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4595  hypothetical protein  32.43 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3250  hypothetical protein  27.6 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3794  hypothetical protein  28.57 
 
 		 465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5174  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  21.83 
 
 		 478 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>